More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_16470 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
291 aa  584  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  53.55 
 
 
294 aa  272  4.0000000000000004e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  48.08 
 
 
296 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.49 
 
 
297 aa  263  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00156943  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5262  enoyl-CoA hydratase  49.83 
 
 
296 aa  261  8e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509281  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5094  enoyl-CoA hydratase  47.86 
 
 
289 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347482  normal  0.857753 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3608  enoyl-CoA hydratase  50.54 
 
 
291 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.793375  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0849  enoyl-CoA hydratase  47.6 
 
 
301 aa  257  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1071  enoyl-CoA hydratase  46.62 
 
 
290 aa  256  3e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231847  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3297  enoyl-CoA hydratase  48.08 
 
 
296 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571809  normal  0.0468568 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2124  enoyl-CoA hydratase  47.6 
 
 
309 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.381981  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2021  enoyl-CoA hydratase  51.23 
 
 
299 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1011  enoyl-CoA hydratase  47.39 
 
 
295 aa  239  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0583  enoyl-CoA hydratase  45.42 
 
 
307 aa  238  5.999999999999999e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0362745  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6455  enoyl-CoA hydratase  47.33 
 
 
293 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0438732 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.73 
 
 
282 aa  229  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1500  enoyl-CoA hydratase  45.08 
 
 
285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1500  enoyl-CoA hydratase  45.08 
 
 
285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1523  enoyl-CoA hydratase  45.08 
 
 
285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.61089  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0752  enoyl-CoA hydratase  41.46 
 
 
298 aa  211  9e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.620367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4488  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.45 
 
 
290 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1394  enoyl-CoA hydratase  45.26 
 
 
288 aa  206  5e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168827  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1010  enoyl-CoA hydratase  41.01 
 
 
292 aa  203  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3638  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.28 
 
 
293 aa  186  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1856  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 
288 aa  186  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.97 
 
 
274 aa  176  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226427  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1147  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.29 
 
 
275 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  38.99 
 
 
270 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  38.65 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1820  enoyl-CoA hydratase  38.58 
 
 
281 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1754  enoyl-CoA hydratase  38.58 
 
 
276 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1773  enoyl-CoA hydratase  38.58 
 
 
281 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  38.32 
 
 
275 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4351  enoyl-CoA hydratase  38.74 
 
 
282 aa  158  8e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00370  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01890)  36.98 
 
 
291 aa  155  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.526484  normal  0.612902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.58 
 
 
279 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 
271 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0054  enoyl-CoA hydratase  36.94 
 
 
270 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1993  enoyl-CoA hydratase  36.6 
 
 
294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.88 
 
 
260 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.47 
 
 
271 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
259 aa  150  3e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3841  enoyl-CoA hydratase  38.83 
 
 
270 aa  149  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.203847 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3400  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.96 
 
 
269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.213114  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.94 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2919  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.23 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0811  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.82 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.7195  normal  0.177861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.21 
 
 
271 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 
268 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.94 
 
 
270 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.86 
 
 
267 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.59 
 
 
264 aa  142  8e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.58 
 
 
269 aa  142  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2378  enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.96 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.32 
 
 
273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.32 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.73 
 
 
274 aa  139  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.08 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.21 
 
 
262 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.6 
 
 
262 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  35.46 
 
 
253 aa  136  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  34.07 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2693  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
313 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2761  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.32 
 
 
261 aa  133  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342506  normal  0.0137889 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  33.7 
 
 
263 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  35.06 
 
 
253 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0644  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
260 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 
264 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 
264 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.47 
 
 
264 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.83 
 
 
269 aa  132  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.09 
 
 
264 aa  132  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.61 
 
 
264 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 
260 aa  132  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1741  enoyl-CoA hydratase  33.83 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0980296  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4299  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  33.83 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  34.8 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1904  enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526145  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  34.8 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  34.8 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  33.7 
 
 
263 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  33.82 
 
 
263 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.48 
 
 
262 aa  130  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.21 
 
 
269 aa  130  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 
267 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  34.14 
 
 
257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.82 
 
 
270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1462  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 
253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.35 
 
 
263 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0298  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.46 
 
 
262 aa  129  7.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  31.68 
 
 
257 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.35 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.36 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  33.73 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.43 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>