More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0481 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
270 aa  559  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  37.54 
 
 
296 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
259 aa  161  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.93 
 
 
282 aa  159  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0849  enoyl-CoA hydratase  39.15 
 
 
301 aa  159  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5262  enoyl-CoA hydratase  38.73 
 
 
296 aa  158  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509281  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  36.5 
 
 
257 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5094  enoyl-CoA hydratase  39.37 
 
 
289 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347482  normal  0.857753 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  38.35 
 
 
294 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1010  enoyl-CoA hydratase  35.42 
 
 
292 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  35.66 
 
 
269 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.59 
 
 
297 aa  152  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00156943  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1071  enoyl-CoA hydratase  35.21 
 
 
290 aa  152  8e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231847  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.19 
 
 
266 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.36 
 
 
258 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  35.58 
 
 
261 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3297  enoyl-CoA hydratase  38.25 
 
 
296 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571809  normal  0.0468568 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  36.78 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3608  enoyl-CoA hydratase  39.61 
 
 
291 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.793375  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.87 
 
 
268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  36 
 
 
270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1014  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.56 
 
 
269 aa  145  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.108431 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4606  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.11 
 
 
257 aa  145  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  35 
 
 
260 aa  145  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.6 
 
 
260 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.57 
 
 
273 aa  145  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  36.19 
 
 
255 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2124  enoyl-CoA hydratase  36.84 
 
 
309 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.381981  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  34.73 
 
 
257 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 
268 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0583  enoyl-CoA hydratase  33.1 
 
 
307 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0362745  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 
291 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1147  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
275 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
274 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226427  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  35 
 
 
262 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6455  enoyl-CoA hydratase  36.59 
 
 
293 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0438732 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 
257 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.2 
 
 
266 aa  142  6e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.73 
 
 
257 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  34.34 
 
 
257 aa  142  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.06 
 
 
273 aa  142  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.06 
 
 
264 aa  142  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.85 
 
 
262 aa  141  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.97 
 
 
260 aa  141  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  33.58 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.73 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.12 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  35.88 
 
 
257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.236024  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 
271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.85 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  31.68 
 
 
259 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.44 
 
 
258 aa  139  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 
266 aa  139  7e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.44 
 
 
260 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  34.35 
 
 
257 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 
257 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 
267 aa  138  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  33.2 
 
 
261 aa  137  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1210  naphthoate synthase  35.71 
 
 
271 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
266 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.57 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 
257 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  33.97 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 
257 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 
259 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4351  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 
282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1011  enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 
295 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  35.51 
 
 
269 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  35.47 
 
 
262 aa  136  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  35.51 
 
 
269 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  35.51 
 
 
269 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
267 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1770  naphthoate synthase  35.98 
 
 
263 aa  135  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.139098 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0912  naphthoate synthase  35.71 
 
 
260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.092423  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 
270 aa  135  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  32.06 
 
 
257 aa  135  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6846  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.52 
 
 
266 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763233  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  35.4 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0450  enoyl-CoA hydratase  34.35 
 
 
258 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  35.56 
 
 
258 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0367  enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.7 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  34.93 
 
 
275 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
257 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  35.66 
 
 
270 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.12 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.44 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  34.07 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0352  enoyl-CoA hydratase  35 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.23 
 
 
273 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  36.16 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6107  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  35.25 
 
 
267 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  33.82 
 
 
260 aa  133  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0389  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 
258 aa  133  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00593018 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1993  enoyl-CoA hydratase  34.59 
 
 
294 aa  133  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  34.81 
 
 
258 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>