More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1794 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
270 aa  548  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  76.05 
 
 
269 aa  418  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.38 
 
 
269 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.05 
 
 
273 aa  244  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  46.79 
 
 
266 aa  241  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  48.67 
 
 
266 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  46.79 
 
 
263 aa  240  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  48.29 
 
 
269 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  48.29 
 
 
269 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  48.29 
 
 
269 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.35 
 
 
271 aa  238  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  47.73 
 
 
287 aa  232  5e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  43.77 
 
 
264 aa  223  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3816  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.23 
 
 
263 aa  221  8e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333763  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  46.86 
 
 
266 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2640  enoyl-CoA hydratase  45.28 
 
 
264 aa  210  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.123759 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2837  enoyl-CoA hydratase  44.91 
 
 
264 aa  209  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.112796 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  40.68 
 
 
257 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 
264 aa  194  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  39.48 
 
 
260 aa  193  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1524  short chain enoyl-CoA hydratase  41.15 
 
 
256 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.85 
 
 
258 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
260 aa  187  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  42.02 
 
 
262 aa  186  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  42.37 
 
 
262 aa  186  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.62 
 
 
260 aa  185  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  38.01 
 
 
260 aa  185  7e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.71 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.93 
 
 
268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.41 
 
 
260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
254 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.72 
 
 
267 aa  180  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.34 
 
 
261 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.66 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  39.19 
 
 
259 aa  179  5.999999999999999e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
260 aa  179  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.01 
 
 
260 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  33.82 
 
 
262 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  39.33 
 
 
253 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.01 
 
 
260 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0855  short chain enoyl-CoA hydratase  37.64 
 
 
263 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  42.02 
 
 
262 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  42.02 
 
 
262 aa  175  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  42.02 
 
 
262 aa  175  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  42.02 
 
 
262 aa  175  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  37.69 
 
 
260 aa  175  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.78 
 
 
268 aa  175  8e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  38.1 
 
 
253 aa  174  9e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  41.63 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  41.63 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.08 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.4 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  39.56 
 
 
263 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  41.63 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.3 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  39.69 
 
 
260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  39.77 
 
 
249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.77 
 
 
249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  39.77 
 
 
249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 
262 aa  172  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  39.54 
 
 
247 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  39.54 
 
 
247 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  39.54 
 
 
247 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.9 
 
 
260 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.64 
 
 
258 aa  171  7.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  36.92 
 
 
258 aa  171  9e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  37.31 
 
 
258 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  35.85 
 
 
258 aa  171  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  37.69 
 
 
267 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.73 
 
 
254 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295779  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  40.86 
 
 
262 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  39.15 
 
 
663 aa  169  3e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
259 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.31 
 
 
260 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1663  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.18 
 
 
367 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.283423 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  36.3 
 
 
260 aa  167  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.01 
 
 
260 aa  167  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2749  enoyl-CoA hydratase  36.94 
 
 
258 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000689883  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.7 
 
 
258 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  34.57 
 
 
260 aa  166  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.08 
 
 
259 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.7 
 
 
260 aa  165  8e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.83 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.41 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1283  short chain enoyl-CoA hydratase  39.34 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  37.87 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.41 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.41 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  35.85 
 
 
263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.72 
 
 
259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  35.93 
 
 
258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.41 
 
 
263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.09 
 
 
255 aa  163  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.27 
 
 
258 aa  163  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  35.56 
 
 
258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 
262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4479  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.02 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  37.31 
 
 
258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  37 
 
 
266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>