More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1147 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1147  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
275 aa  548  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2378  enoyl-CoA hydratase  57.75 
 
 
257 aa  287  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1993  enoyl-CoA hydratase  47.69 
 
 
294 aa  252  5.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4351  enoyl-CoA hydratase  49.43 
 
 
282 aa  249  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2919  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.12 
 
 
275 aa  242  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  49.43 
 
 
270 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1754  enoyl-CoA hydratase  47.51 
 
 
276 aa  238  9e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1820  enoyl-CoA hydratase  47.51 
 
 
281 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  49.42 
 
 
270 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1773  enoyl-CoA hydratase  47.51 
 
 
281 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  49.43 
 
 
275 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0811  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.76 
 
 
281 aa  230  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.7195  normal  0.177861 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3841  enoyl-CoA hydratase  46.69 
 
 
270 aa  221  8e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.203847 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.35 
 
 
262 aa  216  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.73 
 
 
268 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2693  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45 
 
 
313 aa  205  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1904  enoyl-CoA hydratase  48.48 
 
 
272 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526145  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0054  enoyl-CoA hydratase  45.04 
 
 
270 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2761  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.6 
 
 
261 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342506  normal  0.0137889 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.25 
 
 
297 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00156943  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  37.59 
 
 
296 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  40.29 
 
 
291 aa  176  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 
257 aa  172  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5262  enoyl-CoA hydratase  36.3 
 
 
296 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509281  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.13 
 
 
274 aa  170  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226427  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0222  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.8 
 
 
274 aa  169  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3297  enoyl-CoA hydratase  38.69 
 
 
296 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571809  normal  0.0468568 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2124  enoyl-CoA hydratase  38.32 
 
 
309 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.381981  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42 
 
 
279 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  42.05 
 
 
263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 
259 aa  165  6.9999999999999995e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.98 
 
 
273 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 
282 aa  163  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2004  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.91 
 
 
274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0169524 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.64 
 
 
271 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  39.61 
 
 
261 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
294 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.68 
 
 
264 aa  159  6e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0583  enoyl-CoA hydratase  35.84 
 
 
307 aa  156  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0362745  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6455  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 
293 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0438732 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  37.98 
 
 
263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 
267 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.37 
 
 
273 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.87 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.19 
 
 
271 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  35.8 
 
 
262 aa  152  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4488  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
290 aa  152  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 
270 aa  151  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1523  enoyl-CoA hydratase  36.84 
 
 
285 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.61089  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 
258 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 
264 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1500  enoyl-CoA hydratase  36.84 
 
 
285 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.86 
 
 
258 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1500  enoyl-CoA hydratase  36.84 
 
 
285 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  36.72 
 
 
262 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 
265 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  34.63 
 
 
258 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.55 
 
 
271 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3400  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
269 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.213114  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 
263 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1011  enoyl-CoA hydratase  38.4 
 
 
295 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1071  enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 
290 aa  150  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231847  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5094  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 
289 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347482  normal  0.857753 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 
258 aa  149  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.82 
 
 
258 aa  149  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.53 
 
 
260 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0849  enoyl-CoA hydratase  36.92 
 
 
301 aa  149  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  35.8 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.87 
 
 
274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0382  short chain enoyl-CoA hydratase  36.05 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.123728  hitchhiker  0.00785699 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.55 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.5 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 
270 aa  146  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 
265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2372  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.64 
 
 
290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00516706  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0176  short chain enoyl-CoA hydratase  35.66 
 
 
257 aa  145  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.212196  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1010  enoyl-CoA hydratase  34.81 
 
 
292 aa  145  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  36.88 
 
 
276 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 
258 aa  145  9e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.61 
 
 
262 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3608  enoyl-CoA hydratase  37.15 
 
 
291 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.793375  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  38.02 
 
 
262 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.8 
 
 
258 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.15 
 
 
263 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 
264 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 
257 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.75 
 
 
257 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0712  enoyl-CoA hydratase  40.67 
 
 
226 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147994 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.24 
 
 
257 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  38.13 
 
 
258 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 
257 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 
258 aa  143  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 
257 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.85 
 
 
260 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.65 
 
 
260 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
255 aa  142  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  34.9 
 
 
258 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 
258 aa  142  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>