More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4488 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4488  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 290 aa  575  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  51.71 
 
 		 294 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.89 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00156943  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6455  enoyl-CoA hydratase  53.26 
 
 		 293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0438732 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0583  enoyl-CoA hydratase  48.94 
 
 		 307 aa  252  5.000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0362745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5094  enoyl-CoA hydratase  50.18 
 
 		 289 aa  251  9.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347482  normal  0.857753 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0849  enoyl-CoA hydratase  51.32 
 
 		 301 aa  249  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1071  enoyl-CoA hydratase  46.45 
 
 		 290 aa  245  8e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231847  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2021  enoyl-CoA hydratase  53.73 
 
 		 299 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1011  enoyl-CoA hydratase  47.43 
 
 		 295 aa  239  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  45.76 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3608  enoyl-CoA hydratase  48 
 
 		 291 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.793375  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.35 
 
 		 282 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5262  enoyl-CoA hydratase  48.11 
 
 		 296 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509281  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0752  enoyl-CoA hydratase  47.19 
 
 		 298 aa  218  8.999999999999998e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.620367 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1500  enoyl-CoA hydratase  46.21 
 
 		 285 aa  215  7e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  45.45 
 
 		 291 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3297  enoyl-CoA hydratase  46.13 
 
 		 296 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571809  normal  0.0468568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1500  enoyl-CoA hydratase  45.83 
 
 		 285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1523  enoyl-CoA hydratase  45.83 
 
 		 285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.61089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2124  enoyl-CoA hydratase  45.72 
 
 		 309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.381981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1010  enoyl-CoA hydratase  43.49 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1394  enoyl-CoA hydratase  43.64 
 
 		 288 aa  202  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168827  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3638  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.79 
 
 		 293 aa  199  6e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1856  enoyl-CoA hydratase  42.18 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.5 
 
 		 274 aa  175  9e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226427  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00370  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01890)  37.04 
 
 		 291 aa  169  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.526484  normal  0.612902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1993  enoyl-CoA hydratase  38.71 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.6 
 
 		 271 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.23 
 
 		 271 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3400  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.94 
 
 		 269 aa  155  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.213114  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.31 
 
 		 279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2378  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1147  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.94 
 
 		 275 aa  152  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.7 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.09 
 
 		 271 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.26 
 
 		 274 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4351  enoyl-CoA hydratase  35.84 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.23 
 
 		 264 aa  145  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1754  enoyl-CoA hydratase  37.23 
 
 		 276 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1820  enoyl-CoA hydratase  37.23 
 
 		 281 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1773  enoyl-CoA hydratase  37.23 
 
 		 281 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  32.6 
 
 		 261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  37.59 
 
 		 270 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2919  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 		 275 aa  143  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.59 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  38.29 
 
 		 265 aa  142  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  36.67 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  34.15 
 
 		 269 aa  139  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0054  enoyl-CoA hydratase  37.31 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.82 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  36.94 
 
 		 264 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.11 
 
 		 266 aa  136  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.39 
 
 		 266 aa  136  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2693  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.24 
 
 		 313 aa  135  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.67 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  37.82 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3841  enoyl-CoA hydratase  34.22 
 
 		 270 aa  132  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.203847 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.58 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 273 aa  132  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  36.94 
 
 		 264 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 		 260 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.23 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1904  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 		 272 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526145  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.58 
 
 		 267 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.93 
 
 		 269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.21 
 
 		 260 aa  129  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.83 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  34.17 
 
 		 268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1462  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.84 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.07 
 
 		 266 aa  127  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.21 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.35 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0811  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.94 
 
 		 281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.7195  normal  0.177861 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  34.66 
 
 		 266 aa  125  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.28 
 
 		 267 aa  125  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  34.59 
 
 		 260 aa  125  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  34.19 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  34.42 
 
 		 266 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.09 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  31.75 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  36.43 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  33.09 
 
 		 262 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.21 
 
 		 270 aa  124  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.87 
 
 		 269 aa  123  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  31.32 
 
 		 258 aa  122  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  31.32 
 
 		 258 aa  122  7e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 		 258 aa  122  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.98 
 
 		 267 aa  122  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  35.23 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  35.23 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  35.23 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  35.23 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>