More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0111 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 275 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  94.01 
 
 		 270 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  91.79 
 
 		 270 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3841  enoyl-CoA hydratase  72.83 
 
 		 270 aa  404  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.203847 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.4 
 
 		 268 aa  330  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1904  enoyl-CoA hydratase  59.11 
 
 		 272 aa  312  4.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526145  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0054  enoyl-CoA hydratase  56.6 
 
 		 270 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0811  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.09 
 
 		 281 aa  266  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.7195  normal  0.177861 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2378  enoyl-CoA hydratase  51.33 
 
 		 257 aa  248  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4351  enoyl-CoA hydratase  49.43 
 
 		 282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1993  enoyl-CoA hydratase  48.52 
 
 		 294 aa  238  9e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2761  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.28 
 
 		 261 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342506  normal  0.0137889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1147  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.43 
 
 		 275 aa  236  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1754  enoyl-CoA hydratase  45.79 
 
 		 276 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1820  enoyl-CoA hydratase  46.77 
 
 		 281 aa  221  8e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1773  enoyl-CoA hydratase  46.77 
 
 		 281 aa  221  8e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2919  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.49 
 
 		 275 aa  205  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2693  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.56 
 
 		 313 aa  202  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.7 
 
 		 262 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.16 
 
 		 297 aa  186  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00156943  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  38.68 
 
 		 296 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0222  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.12 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5262  enoyl-CoA hydratase  37.89 
 
 		 296 aa  179  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509281  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2124  enoyl-CoA hydratase  37.63 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.381981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 		 271 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  36.8 
 
 		 263 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 		 271 aa  168  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  37.78 
 
 		 294 aa  168  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.61 
 
 		 271 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3297  enoyl-CoA hydratase  37.02 
 
 		 296 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571809  normal  0.0468568 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.19 
 
 		 274 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226427  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  35.34 
 
 		 260 aa  165  8e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.92 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  35.07 
 
 		 263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1071  enoyl-CoA hydratase  36.2 
 
 		 290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231847  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  35.07 
 
 		 263 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.19 
 
 		 264 aa  162  7e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0849  enoyl-CoA hydratase  37.94 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5094  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347482  normal  0.857753 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  38.32 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.94 
 
 		 260 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  35.07 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.09 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  38.02 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  38.11 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6455  enoyl-CoA hydratase  38.52 
 
 		 293 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0438732 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0752  enoyl-CoA hydratase  39.13 
 
 		 298 aa  156  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.620367 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0712  enoyl-CoA hydratase  41.01 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147994 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  38.52 
 
 		 265 aa  155  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.2 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  40.46 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  38.83 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  38.83 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3400  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.87 
 
 		 269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.213114  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  38.83 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  38.83 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  38.83 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  38.83 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  38.83 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 		 274 aa  152  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2004  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.03 
 
 		 274 aa  152  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0169524 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1010  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 		 292 aa  152  7e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  39.62 
 
 		 263 aa  152  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.06 
 
 		 273 aa  150  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.26 
 
 		 264 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.89 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.6 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 		 263 aa  150  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.96 
 
 		 259 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  37.73 
 
 		 263 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  35.4 
 
 		 264 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 		 263 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.46 
 
 		 260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1231  naphthoate synthase  35.21 
 
 		 271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2797  naphthoate synthase  35.07 
 
 		 272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  37.87 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3608  enoyl-CoA hydratase  34.8 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.793375  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.57 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.33 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  33.58 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  35.96 
 
 		 264 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3638  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.62 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.57 
 
 		 279 aa  145  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0995  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.81 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  33.7 
 
 		 267 aa  145  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.15 
 
 		 282 aa  145  9e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  35.82 
 
 		 258 aa  145  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0570  naphthoate synthase  34.59 
 
 		 272 aa  145  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  34.24 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  33.82 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.33 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  33.57 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.8 
 
 		 273 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  36.43 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1394  enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168827  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  34.83 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>