More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1071 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1071  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
290 aa  592  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231847  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0849  enoyl-CoA hydratase  66.78 
 
 
301 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  60.87 
 
 
294 aa  359  3e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  56.9 
 
 
296 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.07 
 
 
297 aa  338  4e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00156943  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5094  enoyl-CoA hydratase  61.99 
 
 
289 aa  335  7e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347482  normal  0.857753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5262  enoyl-CoA hydratase  59.32 
 
 
296 aa  333  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509281  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3608  enoyl-CoA hydratase  63.03 
 
 
291 aa  325  5e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.793375  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3297  enoyl-CoA hydratase  56.61 
 
 
296 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571809  normal  0.0468568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6455  enoyl-CoA hydratase  60.56 
 
 
293 aa  315  6e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0438732 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2124  enoyl-CoA hydratase  56.27 
 
 
309 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.381981  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0583  enoyl-CoA hydratase  54.15 
 
 
307 aa  305  4.0000000000000004e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0362745  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1011  enoyl-CoA hydratase  53.54 
 
 
295 aa  301  7.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2021  enoyl-CoA hydratase  53.92 
 
 
299 aa  281  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0752  enoyl-CoA hydratase  53.63 
 
 
298 aa  277  1e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.620367 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.91 
 
 
282 aa  268  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  46.62 
 
 
291 aa  256  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1010  enoyl-CoA hydratase  46.1 
 
 
292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1394  enoyl-CoA hydratase  51.25 
 
 
288 aa  246  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168827  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1856  enoyl-CoA hydratase  50.9 
 
 
288 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3638  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.65 
 
 
293 aa  243  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4488  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.45 
 
 
290 aa  236  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1523  enoyl-CoA hydratase  38.63 
 
 
285 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.61089  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1500  enoyl-CoA hydratase  38.63 
 
 
285 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1500  enoyl-CoA hydratase  38.63 
 
 
285 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.35 
 
 
274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226427  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00370  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01890)  37.09 
 
 
291 aa  178  9e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.526484  normal  0.612902 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.29 
 
 
264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 
271 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 
270 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1993  enoyl-CoA hydratase  37.1 
 
 
294 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.7 
 
 
271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1754  enoyl-CoA hydratase  38.7 
 
 
276 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1820  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 
281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1773  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 
281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  36.2 
 
 
275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4351  enoyl-CoA hydratase  37.93 
 
 
282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3400  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 
269 aa  162  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.213114  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  36.56 
 
 
270 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.95 
 
 
279 aa  162  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  36.13 
 
 
262 aa  160  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.42 
 
 
271 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 
264 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.08 
 
 
270 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  37.59 
 
 
263 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  37.59 
 
 
263 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  37.59 
 
 
263 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  37.59 
 
 
263 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  37.59 
 
 
263 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  37.59 
 
 
263 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  37.59 
 
 
263 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0811  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.3 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.7195  normal  0.177861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0054  enoyl-CoA hydratase  37.77 
 
 
270 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.21 
 
 
270 aa  152  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.05 
 
 
274 aa  151  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  32.96 
 
 
264 aa  149  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  34.56 
 
 
263 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.32 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2378  enoyl-CoA hydratase  34.96 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.64 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.61 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  33.09 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.51 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1147  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 
275 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  35.32 
 
 
263 aa  146  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  37.13 
 
 
263 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.69 
 
 
263 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  32.36 
 
 
260 aa  144  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.04 
 
 
266 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.83 
 
 
266 aa  143  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  35.21 
 
 
260 aa  142  5e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2919  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.83 
 
 
275 aa  142  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3841  enoyl-CoA hydratase  34.77 
 
 
270 aa  142  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.203847 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  37.31 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1904  enoyl-CoA hydratase  36.2 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526145  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5256  enoyl-CoA hydratase  35.06 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  32.23 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 
265 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.85 
 
 
264 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.37 
 
 
260 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.72 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1457  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.58 
 
 
287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.221294  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  36.84 
 
 
262 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  32.23 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.09 
 
 
259 aa  139  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.16 
 
 
269 aa  139  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.58 
 
 
287 aa  139  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.538415 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.86 
 
 
258 aa  139  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.82 
 
 
267 aa  139  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.56 
 
 
269 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  32.35 
 
 
284 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.93 
 
 
262 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.32 
 
 
260 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.5 
 
 
260 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  35.07 
 
 
262 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.4 
 
 
273 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  36.94 
 
 
264 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.8 
 
 
260 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>