More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2248 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
274 aa  553  1e-157  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226427  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  42.14 
 
 
294 aa  204  9e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.94 
 
 
279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.48 
 
 
297 aa  192  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00156943  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3400  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 
269 aa  186  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.213114  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0849  enoyl-CoA hydratase  38.7 
 
 
301 aa  185  6e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  38.38 
 
 
296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1071  enoyl-CoA hydratase  39.35 
 
 
290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231847  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5094  enoyl-CoA hydratase  40.57 
 
 
289 aa  181  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347482  normal  0.857753 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.63 
 
 
268 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3608  enoyl-CoA hydratase  41.13 
 
 
291 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.793375  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5262  enoyl-CoA hydratase  37.63 
 
 
296 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509281  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0583  enoyl-CoA hydratase  37.54 
 
 
307 aa  181  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0362745  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.91 
 
 
282 aa  176  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  41.97 
 
 
291 aa  176  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2021  enoyl-CoA hydratase  41.94 
 
 
299 aa  175  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6455  enoyl-CoA hydratase  40.43 
 
 
293 aa  175  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0438732 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1011  enoyl-CoA hydratase  38.83 
 
 
295 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2378  enoyl-CoA hydratase  38.74 
 
 
257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2124  enoyl-CoA hydratase  38.03 
 
 
309 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.381981  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4488  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.5 
 
 
290 aa  170  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3297  enoyl-CoA hydratase  38.03 
 
 
296 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571809  normal  0.0468568 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.22 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1147  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 
275 aa  166  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  36.9 
 
 
270 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4351  enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 
282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  35.19 
 
 
275 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 
270 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1993  enoyl-CoA hydratase  37.41 
 
 
294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0752  enoyl-CoA hydratase  39.43 
 
 
298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.620367 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1820  enoyl-CoA hydratase  37.31 
 
 
281 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1773  enoyl-CoA hydratase  37.31 
 
 
281 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1754  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
276 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.68 
 
 
271 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 
271 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2693  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 
313 aa  158  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3638  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.62 
 
 
293 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2761  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.93 
 
 
261 aa  155  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342506  normal  0.0137889 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 
271 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1856  enoyl-CoA hydratase  36.46 
 
 
288 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0811  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.82 
 
 
281 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.7195  normal  0.177861 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3841  enoyl-CoA hydratase  34.46 
 
 
270 aa  152  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.203847 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  33.59 
 
 
261 aa  150  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.09 
 
 
259 aa  149  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 
261 aa  149  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1010  enoyl-CoA hydratase  33.69 
 
 
292 aa  148  7e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00370  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01890)  35.83 
 
 
291 aa  146  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.526484  normal  0.612902 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.94 
 
 
264 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1500  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
285 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1523  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
285 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.61089  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1500  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 
274 aa  146  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.68 
 
 
259 aa  145  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  32.69 
 
 
258 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.69 
 
 
258 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.56 
 
 
260 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
270 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 
258 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  34.46 
 
 
258 aa  142  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.58 
 
 
269 aa  142  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 
260 aa  142  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1394  enoyl-CoA hydratase  34.49 
 
 
288 aa  141  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168827  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  34.08 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.5 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.78 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  34.36 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  34.83 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  34.36 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  31.46 
 
 
259 aa  140  3e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  33.2 
 
 
260 aa  139  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0802  enoyl-CoA hydratase  39.3 
 
 
265 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.02 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.7 
 
 
269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  34.08 
 
 
258 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.97 
 
 
262 aa  139  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.27 
 
 
267 aa  139  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.75 
 
 
261 aa  138  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.05 
 
 
260 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2919  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 
275 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  31.44 
 
 
258 aa  138  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.98 
 
 
264 aa  138  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.56 
 
 
260 aa  137  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  31.56 
 
 
265 aa  137  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.22 
 
 
266 aa  137  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 
258 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1741  enoyl-CoA hydratase  33.83 
 
 
265 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0980296  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  34.11 
 
 
259 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.57 
 
 
260 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.02 
 
 
258 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.48 
 
 
258 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  32.45 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
258 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0516  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
258 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195576  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.6 
 
 
259 aa  136  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.18 
 
 
260 aa  136  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.2 
 
 
659 aa  135  5e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.54 
 
 
260 aa  135  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0474  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.0000000000253276  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0449  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.1 
 
 
260 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>