More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0583 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0583  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
307 aa  623  1e-177  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0362745  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0849  enoyl-CoA hydratase  58.09 
 
 
301 aa  340  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  52.44 
 
 
296 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  55.1 
 
 
294 aa  311  5.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2021  enoyl-CoA hydratase  58.42 
 
 
299 aa  310  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5094  enoyl-CoA hydratase  54.1 
 
 
289 aa  310  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347482  normal  0.857753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5262  enoyl-CoA hydratase  53.09 
 
 
296 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509281  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3608  enoyl-CoA hydratase  55.88 
 
 
291 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.793375  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1071  enoyl-CoA hydratase  54.15 
 
 
290 aa  305  5.0000000000000004e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231847  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1011  enoyl-CoA hydratase  53.27 
 
 
295 aa  294  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2124  enoyl-CoA hydratase  52.12 
 
 
309 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.381981  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3297  enoyl-CoA hydratase  51.47 
 
 
296 aa  291  9e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571809  normal  0.0468568 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.07 
 
 
282 aa  289  4e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6455  enoyl-CoA hydratase  53.56 
 
 
293 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0438732 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.85 
 
 
297 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00156943  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0752  enoyl-CoA hydratase  49.83 
 
 
298 aa  249  6e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.620367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4488  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.94 
 
 
290 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  45.42 
 
 
291 aa  238  5.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1500  enoyl-CoA hydratase  43.86 
 
 
285 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1500  enoyl-CoA hydratase  43.51 
 
 
285 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1523  enoyl-CoA hydratase  43.51 
 
 
285 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.61089  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1010  enoyl-CoA hydratase  42.27 
 
 
292 aa  222  6e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3638  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.96 
 
 
293 aa  218  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1856  enoyl-CoA hydratase  43.43 
 
 
288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1394  enoyl-CoA hydratase  45.88 
 
 
288 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168827  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.54 
 
 
274 aa  181  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226427  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00370  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01890)  34.56 
 
 
291 aa  162  8.000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.526484  normal  0.612902 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0054  enoyl-CoA hydratase  37.67 
 
 
270 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.48 
 
 
279 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3400  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.14 
 
 
269 aa  155  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.213114  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1147  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.84 
 
 
275 aa  152  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1754  enoyl-CoA hydratase  36.79 
 
 
276 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1993  enoyl-CoA hydratase  34.72 
 
 
294 aa  152  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1773  enoyl-CoA hydratase  36.79 
 
 
281 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1820  enoyl-CoA hydratase  36.79 
 
 
281 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  35.35 
 
 
270 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  34.14 
 
 
270 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.1 
 
 
270 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3841  enoyl-CoA hydratase  34.13 
 
 
270 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.203847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4351  enoyl-CoA hydratase  33.22 
 
 
282 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.15 
 
 
268 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2919  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.97 
 
 
275 aa  142  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2378  enoyl-CoA hydratase  34.71 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  34.14 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
270 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1904  enoyl-CoA hydratase  34.81 
 
 
272 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526145  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  35.61 
 
 
265 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  31.82 
 
 
258 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
268 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.02 
 
 
259 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0811  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 
281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.7195  normal  0.177861 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.23 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.04 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2761  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.94 
 
 
261 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342506  normal  0.0137889 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.82 
 
 
256 aa  132  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.86 
 
 
270 aa  132  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  32.42 
 
 
263 aa  132  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.91 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.37 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.07 
 
 
260 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  32.08 
 
 
263 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.5 
 
 
271 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.74 
 
 
267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  32.87 
 
 
267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.72 
 
 
260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.86 
 
 
265 aa  129  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  30.03 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.01 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.76 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  31.97 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.1 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  30.69 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  29.5 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.32 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.86 
 
 
262 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.12 
 
 
260 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.02 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.75 
 
 
271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  32.08 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  31.47 
 
 
258 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.47 
 
 
259 aa  125  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0328  hypothetical protein  29.17 
 
 
261 aa  125  1e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.52 
 
 
257 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.42 
 
 
257 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  34.14 
 
 
263 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  31.71 
 
 
284 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.31 
 
 
260 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 
257 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 
257 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.58 
 
 
259 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  28.47 
 
 
260 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  29.07 
 
 
258 aa  123  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  28.47 
 
 
260 aa  123  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  32.18 
 
 
263 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.86 
 
 
258 aa  123  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.42 
 
 
257 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.27 
 
 
274 aa  122  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1417  enoyl-CoA hydratase  36.04 
 
 
258 aa  122  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  35.4 
 
 
260 aa  122  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2372  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.62 
 
 
290 aa  122  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00516706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>