More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0811 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0811  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 281 aa  579  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.7195  normal  0.177861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  50.72 
 
 		 270 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  50.71 
 
 		 270 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  51.09 
 
 		 275 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3841  enoyl-CoA hydratase  49.29 
 
 		 270 aa  273  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.203847 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1904  enoyl-CoA hydratase  51.81 
 
 		 272 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526145  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0054  enoyl-CoA hydratase  47.33 
 
 		 270 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2761  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.42 
 
 		 261 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342506  normal  0.0137889 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.37 
 
 		 268 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1147  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.27 
 
 		 275 aa  231  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1993  enoyl-CoA hydratase  45.68 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2378  enoyl-CoA hydratase  45.05 
 
 		 257 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4351  enoyl-CoA hydratase  43.84 
 
 		 282 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1754  enoyl-CoA hydratase  41.76 
 
 		 276 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1773  enoyl-CoA hydratase  41.76 
 
 		 281 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1820  enoyl-CoA hydratase  41.76 
 
 		 281 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.15 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2919  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.09 
 
 		 275 aa  188  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0222  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.14 
 
 		 274 aa  182  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2693  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.36 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  36.84 
 
 		 296 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.82 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226427  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.79 
 
 		 257 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  36.3 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5262  enoyl-CoA hydratase  34.46 
 
 		 296 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509281  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.62 
 
 		 297 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00156943  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  38.55 
 
 		 294 aa  165  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1071  enoyl-CoA hydratase  36.3 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231847  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0849  enoyl-CoA hydratase  38.01 
 
 		 301 aa  162  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2124  enoyl-CoA hydratase  36.14 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.381981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.17 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0712  enoyl-CoA hydratase  41.23 
 
 		 226 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147994 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3297  enoyl-CoA hydratase  36.14 
 
 		 296 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571809  normal  0.0468568 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  35.82 
 
 		 291 aa  159  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3400  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 		 269 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.213114  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.31 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.91 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.25 
 
 		 279 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3608  enoyl-CoA hydratase  36.49 
 
 		 291 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.793375  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  34.16 
 
 		 263 aa  155  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1011  enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.94 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6455  enoyl-CoA hydratase  36.3 
 
 		 293 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0438732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5094  enoyl-CoA hydratase  36.17 
 
 		 289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347482  normal  0.857753 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0752  enoyl-CoA hydratase  37.06 
 
 		 298 aa  152  8e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.620367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.36 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.85 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  33.1 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  33.81 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.65 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  32.76 
 
 		 263 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  32.76 
 
 		 263 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  32.76 
 
 		 263 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  32.76 
 
 		 263 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  32.76 
 
 		 263 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  32.76 
 
 		 263 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  32.76 
 
 		 263 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1394  enoyl-CoA hydratase  34.84 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168827  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  31.91 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.25 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2004  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.18 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0169524 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0583  enoyl-CoA hydratase  34.36 
 
 		 307 aa  146  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0362745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  32.62 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  32.08 
 
 		 263 aa  145  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 		 266 aa  145  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  35.21 
 
 		 264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  32.51 
 
 		 267 aa  145  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  31.91 
 
 		 263 aa  145  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.49 
 
 		 271 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1010  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 		 292 aa  143  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  33.92 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.94 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.68 
 
 		 265 aa  142  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2021  enoyl-CoA hydratase  36.62 
 
 		 299 aa  142  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.92 
 
 		 267 aa  142  6e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  32.27 
 
 		 263 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.05 
 
 		 271 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  32.38 
 
 		 265 aa  142  8e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  34.35 
 
 		 266 aa  141  9e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.38 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  34.04 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  34.93 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  29.89 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  33.93 
 
 		 264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.36 
 
 		 267 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  33.82 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2372  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.96 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00516706  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3638  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.83 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  34.05 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.56 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.56 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4488  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.94 
 
 		 290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  35.79 
 
 		 260 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.58 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  33.69 
 
 		 264 aa  136  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.06 
 
 		 268 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.12 
 
 		 274 aa  136  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  33.67 
 
 		 266 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.97 
 
 		 270 aa  136  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>