More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4217 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 259 aa  529  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.72 
 
 		 265 aa  288  7e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.49 
 
 		 259 aa  238  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.02 
 
 		 257 aa  209  4e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  39.31 
 
 		 263 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 		 263 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  39.69 
 
 		 263 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  39.31 
 
 		 263 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  41.2 
 
 		 261 aa  201  8e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  40.61 
 
 		 263 aa  201  9e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  43.13 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  41.22 
 
 		 263 aa  195  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.7 
 
 		 270 aa  195  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  39.54 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  39.16 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  41.76 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  44.66 
 
 		 263 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1130  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  43.46 
 
 		 259 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.85 
 
 		 260 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.98 
 
 		 260 aa  179  5.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  41.6 
 
 		 260 aa  178  7e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.47 
 
 		 257 aa  178  8e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.92 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  41.67 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  39.7 
 
 		 267 aa  175  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  37.7 
 
 		 260 aa  175  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  38 
 
 		 263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  38 
 
 		 263 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  38 
 
 		 263 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  38 
 
 		 263 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  38 
 
 		 263 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  38 
 
 		 263 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  38 
 
 		 263 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  38 
 
 		 263 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.23 
 
 		 270 aa  171  6.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.08 
 
 		 265 aa  171  6.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.84 
 
 		 259 aa  169  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.21 
 
 		 259 aa  170  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.39 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  37.22 
 
 		 261 aa  169  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  36.89 
 
 		 259 aa  169  5e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  36.64 
 
 		 264 aa  168  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1813  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.75 
 
 		 272 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 		 260 aa  168  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1747  enoyl-CoA hydratase  37.75 
 
 		 272 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1766  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.75 
 
 		 272 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.27 
 
 		 260 aa  168  7e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  39.61 
 
 		 260 aa  168  8e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1985  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.82 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  40.86 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  36.58 
 
 		 266 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.46 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  37.85 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  37.2 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  37.79 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.74 
 
 		 268 aa  166  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  35.41 
 
 		 280 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 		 266 aa  166  5e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  38.96 
 
 		 262 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 		 266 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.97 
 
 		 273 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3979  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.25 
 
 		 256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.23 
 
 		 267 aa  165  8e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  40.24 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  35.11 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4089  enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  38.37 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06370  Enoyl-CoA hydratase  39.62 
 
 		 283 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.622554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.11 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  36.08 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.85 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2154  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.8 
 
 		 260 aa  162  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  35.58 
 
 		 265 aa  162  7e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.4 
 
 		 258 aa  161  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372212  normal  0.332854 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  37.07 
 
 		 263 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  37.07 
 
 		 263 aa  160  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  39.04 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.15 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.97 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  39.04 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 		 258 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.72 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.91 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.93 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  38.78 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.11 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.37 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.12 
 
 		 261 aa  159  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4359  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 		 268 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  37.3 
 
 		 263 aa  159  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  37.09 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>