More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0749 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  100 
 
 
263 aa  531  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  59.16 
 
 
263 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  58.17 
 
 
263 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  57.74 
 
 
263 aa  308  4e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  57.74 
 
 
263 aa  308  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  57.74 
 
 
263 aa  308  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  57.74 
 
 
263 aa  308  4e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  57.74 
 
 
263 aa  308  4e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  57.74 
 
 
263 aa  308  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  57.74 
 
 
263 aa  308  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  57.03 
 
 
263 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  57.03 
 
 
264 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  57.41 
 
 
263 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  56.6 
 
 
263 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  59.14 
 
 
280 aa  300  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  54.37 
 
 
264 aa  298  8e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  62.11 
 
 
276 aa  297  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  58.27 
 
 
260 aa  297  1e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  58.08 
 
 
262 aa  297  1e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  55.34 
 
 
263 aa  296  3e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  58.02 
 
 
263 aa  295  8e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  61.13 
 
 
261 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  58.85 
 
 
262 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  58.46 
 
 
262 aa  281  6.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  58.46 
 
 
262 aa  281  6.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  57.69 
 
 
262 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  57.36 
 
 
263 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  58.11 
 
 
263 aa  279  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0446  enoyl-CoA hydratase  57.36 
 
 
263 aa  279  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  57.71 
 
 
261 aa  278  8e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0471  enoyl-CoA hydratase  57.36 
 
 
263 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0802767  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  57.36 
 
 
263 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  57.36 
 
 
263 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  56.98 
 
 
263 aa  275  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2853  enoyl-CoA hydratase  57.74 
 
 
263 aa  275  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00948295  normal  0.659081 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3488  enoyl-CoA hydratase  58.87 
 
 
263 aa  271  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000267739 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2691  enoyl-CoA hydratase  56.98 
 
 
263 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103859  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  54.37 
 
 
263 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  50.79 
 
 
262 aa  267  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  56.3 
 
 
263 aa  261  6e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3015  enoyl-CoA hydratase  58.91 
 
 
274 aa  257  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1238  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.11 
 
 
267 aa  257  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  51.97 
 
 
262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.19 
 
 
270 aa  249  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0984  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  56.02 
 
 
266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0681  enoyl-CoA hydratase  53.99 
 
 
263 aa  242  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0568  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.73 
 
 
260 aa  240  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3363  enoyl-CoA hydratase  59.07 
 
 
261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2873  enoyl-CoA hydratase  53.99 
 
 
262 aa  235  6e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00237837  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  47.35 
 
 
284 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  44.74 
 
 
261 aa  231  9e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2750  enoyl-CoA hydratase  54.37 
 
 
262 aa  231  9e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00030401  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2405  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.33 
 
 
272 aa  231  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3115  enoyl-CoA hydratase  53.99 
 
 
262 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000284376  normal  0.0714988 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.44 
 
 
257 aa  225  7e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  44.7 
 
 
263 aa  224  8e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.25 
 
 
267 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  43.56 
 
 
264 aa  218  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.64 
 
 
260 aa  212  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  41.42 
 
 
266 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  45.96 
 
 
260 aa  209  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  52.08 
 
 
263 aa  208  8e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  44.05 
 
 
261 aa  205  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2154  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  45.63 
 
 
258 aa  204  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182629  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  43.33 
 
 
267 aa  201  8e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3942  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.36 
 
 
277 aa  199  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.908952  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.15 
 
 
258 aa  198  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372212  normal  0.332854 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  38.81 
 
 
266 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1130  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  43.35 
 
 
259 aa  198  7.999999999999999e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.38 
 
 
263 aa  198  9e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0214768  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  38.81 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.62 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3979  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.35 
 
 
256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.22 
 
 
259 aa  195  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  43.08 
 
 
266 aa  191  9e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1753  enoyl-CoA hydratase  44.49 
 
 
258 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.228549 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1715  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.78 
 
 
264 aa  188  8e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.45 
 
 
258 aa  188  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.886446  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.23 
 
 
264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 
261 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0444  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.62 
 
 
268 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.41 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.46 
 
 
270 aa  177  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 
268 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.76 
 
 
262 aa  176  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.85 
 
 
257 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.21 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3726  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.91 
 
 
258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.11 
 
 
265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.93 
 
 
271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 
266 aa  172  5e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 
273 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  37.64 
 
 
259 aa  171  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
265 aa  170  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.98 
 
 
261 aa  169  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.41 
 
 
264 aa  169  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.43 
 
 
271 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.17 
 
 
271 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  38.17 
 
 
266 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06370  Enoyl-CoA hydratase  44.49 
 
 
283 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.622554  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>