More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0371 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
264 aa  541  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  86.74 
 
 
264 aa  477  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  58.49 
 
 
263 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  58.49 
 
 
263 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  58.49 
 
 
263 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  58.49 
 
 
263 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  58.49 
 
 
263 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  58.49 
 
 
263 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  58.49 
 
 
263 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  56.98 
 
 
263 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  54.37 
 
 
263 aa  298  8e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  56.98 
 
 
280 aa  288  7e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  54.75 
 
 
263 aa  288  8e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  59.62 
 
 
263 aa  285  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2691  enoyl-CoA hydratase  59.62 
 
 
263 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103859  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3488  enoyl-CoA hydratase  58.87 
 
 
263 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000267739 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  51.14 
 
 
263 aa  270  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  50.57 
 
 
263 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  50.57 
 
 
263 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  56.98 
 
 
263 aa  269  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  50.95 
 
 
263 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  56.98 
 
 
263 aa  268  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  56.98 
 
 
263 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  56.98 
 
 
263 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0446  enoyl-CoA hydratase  56.23 
 
 
263 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0471  enoyl-CoA hydratase  56.23 
 
 
263 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0802767  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2873  enoyl-CoA hydratase  57.94 
 
 
262 aa  263  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00237837  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2853  enoyl-CoA hydratase  56.23 
 
 
263 aa  263  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00948295  normal  0.659081 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1238  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.63 
 
 
267 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2750  enoyl-CoA hydratase  55.09 
 
 
262 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00030401  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3115  enoyl-CoA hydratase  54.72 
 
 
262 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000284376  normal  0.0714988 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3015  enoyl-CoA hydratase  57.03 
 
 
274 aa  256  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  53.78 
 
 
263 aa  256  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  53.44 
 
 
261 aa  254  8e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  50.4 
 
 
260 aa  249  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  50.19 
 
 
262 aa  250  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  52.59 
 
 
276 aa  249  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  53.05 
 
 
262 aa  246  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.39 
 
 
270 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  52.67 
 
 
262 aa  242  5e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  52.67 
 
 
262 aa  242  5e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  51.53 
 
 
262 aa  241  9e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0568  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.24 
 
 
260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2405  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.99 
 
 
272 aa  238  5.999999999999999e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  49.42 
 
 
263 aa  238  6.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0984  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  52.83 
 
 
266 aa  238  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  49.2 
 
 
261 aa  229  4e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  48.29 
 
 
262 aa  228  6e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  42.21 
 
 
261 aa  228  6e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  44.44 
 
 
262 aa  228  7e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.46 
 
 
257 aa  223  3e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  43.56 
 
 
263 aa  217  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1130  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  47.15 
 
 
259 aa  216  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2154  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  47.91 
 
 
258 aa  215  5.9999999999999996e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182629  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3979  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.05 
 
 
256 aa  214  8e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0681  enoyl-CoA hydratase  49.81 
 
 
263 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  46.12 
 
 
261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.15 
 
 
258 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372212  normal  0.332854 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  49.43 
 
 
263 aa  204  9e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1753  enoyl-CoA hydratase  47.15 
 
 
258 aa  204  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.228549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3363  enoyl-CoA hydratase  50.2 
 
 
261 aa  202  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.63 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.886446  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.21 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0214768  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  42.38 
 
 
284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  40.75 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  39.85 
 
 
266 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3942  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.82 
 
 
277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.908952  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  40.15 
 
 
266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  39.85 
 
 
266 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.46 
 
 
267 aa  189  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.62 
 
 
268 aa  186  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  40.67 
 
 
267 aa  186  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  41.6 
 
 
266 aa  185  5e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.46 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0444  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.04 
 
 
268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1715  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.2 
 
 
264 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.63 
 
 
260 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  41.67 
 
 
260 aa  179  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
264 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.61 
 
 
265 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.93 
 
 
260 aa  169  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.15 
 
 
257 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.46 
 
 
256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.63 
 
 
267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4579  enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 
278 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781565  normal  0.154982 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6299  short chain enoyl-CoA hydratase  39.16 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.11 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.43 
 
 
255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  39.69 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.16 
 
 
262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 
265 aa  163  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.46 
 
 
264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4145  enoyl-CoA hydratase  37.08 
 
 
272 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4070  enoyl-CoA hydratase  37.08 
 
 
272 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.8 
 
 
261 aa  160  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.02 
 
 
273 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.22 
 
 
264 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4299  enoyl-CoA hydratase  36.7 
 
 
272 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621755  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>