More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0568 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0568  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 260 aa  512  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0984  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  69.55 
 
 		 266 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1238  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  65.92 
 
 		 267 aa  297  9e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2405  enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.6 
 
 		 272 aa  282  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  55.73 
 
 		 263 aa  281  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  55.24 
 
 		 264 aa  276  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  55.78 
 
 		 264 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3942  enoyl-CoA hydratase/isomerase  67.15 
 
 		 277 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.908952  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  57.42 
 
 		 263 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  55.42 
 
 		 263 aa  267  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  55.08 
 
 		 280 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  53.7 
 
 		 263 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  53.7 
 
 		 263 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  53.7 
 
 		 263 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  53.7 
 
 		 263 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  53.7 
 
 		 263 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  53.7 
 
 		 263 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  53.7 
 
 		 263 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  53.49 
 
 		 263 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  53.49 
 
 		 263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  53.88 
 
 		 263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  56.49 
 
 		 263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  54.03 
 
 		 263 aa  249  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  54.05 
 
 		 261 aa  244  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  57.59 
 
 		 263 aa  242  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2691  enoyl-CoA hydratase  56.42 
 
 		 263 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  52.73 
 
 		 262 aa  238  9e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  54.72 
 
 		 276 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  51.74 
 
 		 262 aa  237  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  50.19 
 
 		 260 aa  237  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  47.45 
 
 		 262 aa  236  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  54.09 
 
 		 263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2853  enoyl-CoA hydratase  57.03 
 
 		 263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00948295  normal  0.659081 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  51.35 
 
 		 262 aa  233  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  51.35 
 
 		 262 aa  233  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  54.86 
 
 		 263 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  54.51 
 
 		 263 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3488  enoyl-CoA hydratase  57.2 
 
 		 263 aa  229  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000267739 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  54.51 
 
 		 263 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  54.51 
 
 		 263 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  50.98 
 
 		 262 aa  226  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  51.7 
 
 		 263 aa  226  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  48.26 
 
 		 261 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0446  enoyl-CoA hydratase  53.91 
 
 		 263 aa  225  7e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.63 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0471  enoyl-CoA hydratase  55.65 
 
 		 263 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0802767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.38 
 
 		 260 aa  219  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  51.16 
 
 		 262 aa  219  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  49.02 
 
 		 261 aa  219  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2873  enoyl-CoA hydratase  52.11 
 
 		 262 aa  218  6e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00237837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3015  enoyl-CoA hydratase  55.43 
 
 		 274 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  43.6 
 
 		 261 aa  217  2e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2750  enoyl-CoA hydratase  51.72 
 
 		 262 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00030401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0681  enoyl-CoA hydratase  53.44 
 
 		 263 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3115  enoyl-CoA hydratase  51.34 
 
 		 262 aa  215  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000284376  normal  0.0714988 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  54.34 
 
 		 263 aa  208  9e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  47.53 
 
 		 284 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.27 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.09 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2154  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  47.6 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  45.6 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  45.63 
 
 		 260 aa  198  6e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  44.53 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  44.98 
 
 		 264 aa  195  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.45 
 
 		 258 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372212  normal  0.332854 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  42.15 
 
 		 266 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  46.33 
 
 		 266 aa  192  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3363  enoyl-CoA hydratase  54.24 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.54 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.886446  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.79 
 
 		 263 aa  188  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0214768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3979  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  42.29 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.8 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.18 
 
 		 273 aa  185  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  41 
 
 		 266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.64 
 
 		 268 aa  182  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06370  Enoyl-CoA hydratase  46.24 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.622554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.46 
 
 		 265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1753  enoyl-CoA hydratase  43.08 
 
 		 258 aa  178  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.228549 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1130  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  42.63 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.24 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  34.46 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1715  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.8 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4145  enoyl-CoA hydratase  40.38 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4070  enoyl-CoA hydratase  40.38 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4299  enoyl-CoA hydratase  40.38 
 
 		 272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.11 
 
 		 259 aa  172  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.45 
 
 		 273 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.02 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.75 
 
 		 270 aa  170  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.76 
 
 		 261 aa  170  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4579  enoyl-CoA hydratase  41.18 
 
 		 278 aa  168  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781565  normal  0.154982 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1797  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.85 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.67 
 
 		 260 aa  166  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19430  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  43.73 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0126218 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1205  enoyl-CoA hydratase  44.66 
 
 		 264 aa  166  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.755368  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1300  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  42 
 
 		 256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132411  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  41.7 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  43.08 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>