More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1300 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1300  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
256 aa  493  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132411  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4579  enoyl-CoA hydratase  52.14 
 
 
278 aa  219  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781565  normal  0.154982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4070  enoyl-CoA hydratase  49.61 
 
 
272 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4145  enoyl-CoA hydratase  49.61 
 
 
272 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4299  enoyl-CoA hydratase  49.22 
 
 
272 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621755  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11165  enoyl-CoA hydratase  48.44 
 
 
268 aa  198  7e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.192459 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4089  enoyl-CoA hydratase  45.88 
 
 
251 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11164  enoyl-CoA hydratase  47.83 
 
 
268 aa  181  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.351304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.37 
 
 
259 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  43.65 
 
 
261 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2125  enoyl-CoA hydratase  48.59 
 
 
269 aa  169  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  0.104837 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.72 
 
 
270 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4185  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.22 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3130  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.06 
 
 
274 aa  166  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.22 
 
 
255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  39.53 
 
 
260 aa  161  8.000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  37.11 
 
 
262 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  43.75 
 
 
260 aa  161  9e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  41.27 
 
 
264 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  39.04 
 
 
263 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  37.85 
 
 
263 aa  158  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  40.77 
 
 
264 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  39.04 
 
 
263 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.7 
 
 
270 aa  156  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  41.77 
 
 
263 aa  156  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2517  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.15 
 
 
259 aa  155  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.64 
 
 
260 aa  155  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  40.64 
 
 
262 aa  154  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  41.29 
 
 
267 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.07 
 
 
259 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 
263 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 
263 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 
263 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 
263 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  37.11 
 
 
263 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 
263 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 
263 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 
263 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.11 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
267 aa  152  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.76 
 
 
277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  40.7 
 
 
266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 
262 aa  151  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.2 
 
 
261 aa  151  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  39.84 
 
 
262 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.89 
 
 
270 aa  151  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
263 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 
262 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  36.99 
 
 
258 aa  151  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  39.22 
 
 
259 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  38.25 
 
 
263 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.64 
 
 
265 aa  149  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  36.84 
 
 
258 aa  149  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  38.34 
 
 
261 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1813  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.93 
 
 
272 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  36.65 
 
 
258 aa  149  4e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1766  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.93 
 
 
272 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1747  enoyl-CoA hydratase  38.93 
 
 
272 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.35 
 
 
258 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2444  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.93 
 
 
268 aa  149  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  42.69 
 
 
263 aa  149  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.32 
 
 
273 aa  148  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  42.41 
 
 
276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2136  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.259318  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.68 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  40.48 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  36.58 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.7 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.76 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  37.94 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  38.71 
 
 
661 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 
260 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 
261 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  38.76 
 
 
263 aa  144  9e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 
257 aa  144  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
261 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.65 
 
 
258 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.59 
 
 
258 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  38.74 
 
 
261 aa  143  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1551  enoyl-CoA hydratase  38.87 
 
 
253 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.11 
 
 
287 aa  142  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1087  enoyl-CoA hydratase  36.9 
 
 
260 aa  142  6e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.06 
 
 
260 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.97 
 
 
258 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.14 
 
 
258 aa  142  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0654  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.76 
 
 
263 aa  142  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  38.95 
 
 
266 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.93 
 
 
268 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.64 
 
 
273 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.85 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.05 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  39.04 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  35.86 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.08 
 
 
256 aa  139  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06370  Enoyl-CoA hydratase  42.59 
 
 
283 aa  139  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.622554  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 
255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  38.4 
 
 
257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>