More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1306 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
263 aa  532  1e-150  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  43.48 
 
 
662 aa  205  7e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  43.37 
 
 
663 aa  204  8e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  43.55 
 
 
259 aa  205  8e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  43.18 
 
 
262 aa  204  9e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.8 
 
 
260 aa  202  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.42 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  43.13 
 
 
662 aa  201  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.8 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  42.11 
 
 
661 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  43.87 
 
 
662 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.06 
 
 
265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.6 
 
 
259 aa  192  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  41.42 
 
 
260 aa  192  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  43.56 
 
 
251 aa  192  6e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  42.7 
 
 
262 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  40.68 
 
 
258 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  41.11 
 
 
258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3544  enoyl-CoA hydratase  40.68 
 
 
258 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000159011  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.77 
 
 
261 aa  188  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  42.97 
 
 
260 aa  188  9e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 
266 aa  187  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  41.27 
 
 
659 aa  187  1e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.47 
 
 
259 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  39.25 
 
 
258 aa  187  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.77 
 
 
260 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 
258 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0544  enoyl-CoA hydratase  40.3 
 
 
258 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.0000000212345  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
259 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0930  enoyl-CoA hydratase  40.3 
 
 
258 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286464  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3563  enoyl-CoA hydratase  40.3 
 
 
258 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063446  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1899  enoyl-CoA hydratase  40.3 
 
 
258 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000141088  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3571  enoyl-CoA hydratase  40.3 
 
 
264 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00545367  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0632  enoyl-CoA hydratase  40.3 
 
 
258 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040968  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  39.39 
 
 
260 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  41.18 
 
 
283 aa  186  4e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  40.68 
 
 
258 aa  186  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 
258 aa  186  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.43 
 
 
260 aa  186  4e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  41.29 
 
 
258 aa  185  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  39.69 
 
 
651 aa  184  9e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  40.68 
 
 
258 aa  184  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  40.15 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0449  enoyl-CoA hydratase  39.16 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0516  enoyl-CoA hydratase  39.54 
 
 
258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195576  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0474  enoyl-CoA hydratase  39.16 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.0000000000253276  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.94 
 
 
270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.35 
 
 
260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.29 
 
 
258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.88 
 
 
260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2688  enoyl-CoA hydratase  40.91 
 
 
258 aa  182  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000000387614  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0544  enoyl-CoA hydratase  39.16 
 
 
258 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181699  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2561  enoyl-CoA hydratase  39.16 
 
 
258 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000238691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.35 
 
 
260 aa  181  7e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.77 
 
 
260 aa  181  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.39 
 
 
261 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  41.67 
 
 
260 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1709  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.25 
 
 
256 aa  180  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.04 
 
 
258 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0471  enoyl-CoA hydratase  39.77 
 
 
258 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000928124  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3631  enoyl-CoA hydratase  38.4 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251765  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.75 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  38.37 
 
 
255 aa  179  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  38.72 
 
 
265 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  41.67 
 
 
258 aa  179  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41 
 
 
258 aa  179  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  38.11 
 
 
258 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.16 
 
 
258 aa  178  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  39.92 
 
 
275 aa  178  8e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  37.92 
 
 
257 aa  178  9e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  43.08 
 
 
259 aa  178  9e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2749  enoyl-CoA hydratase  40.91 
 
 
258 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000689883  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  40.38 
 
 
259 aa  177  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1716  short chain enoyl-CoA hydratase  42.05 
 
 
260 aa  178  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.923335  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 
260 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  37.88 
 
 
260 aa  177  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.15 
 
 
260 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
257 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1795  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.86 
 
 
256 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.11 
 
 
259 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.84 
 
 
260 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.76 
 
 
258 aa  176  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 
258 aa  176  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  40.6 
 
 
258 aa  176  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  38.4 
 
 
257 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.31 
 
 
258 aa  176  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.13 
 
 
255 aa  176  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.85 
 
 
264 aa  176  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.02 
 
 
258 aa  175  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  38.02 
 
 
258 aa  175  6e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  41.13 
 
 
258 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.43 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  41.11 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  38.4 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  39.31 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.6 
 
 
259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  37.26 
 
 
257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.64 
 
 
258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.38 
 
 
268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.02 
 
 
259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>