More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2207 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
265 aa  541  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.87 
 
 
262 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.48 
 
 
260 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  42.42 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.25 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  42.64 
 
 
260 aa  199  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  42.48 
 
 
260 aa  199  5e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  42.21 
 
 
260 aa  198  7.999999999999999e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.94 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  41.83 
 
 
260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.75 
 
 
260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.44 
 
 
258 aa  194  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.44 
 
 
258 aa  191  8e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.6 
 
 
260 aa  191  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.29 
 
 
259 aa  190  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.22 
 
 
258 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  41.22 
 
 
256 aa  187  1e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  41.79 
 
 
258 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.38 
 
 
260 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  42.26 
 
 
260 aa  187  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  40.62 
 
 
258 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  40.82 
 
 
257 aa  186  4e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.91 
 
 
259 aa  185  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  43.49 
 
 
257 aa  185  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  40.52 
 
 
258 aa  185  7e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  39.47 
 
 
260 aa  185  7e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  40.45 
 
 
257 aa  184  9e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.11 
 
 
258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.31 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.49 
 
 
260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  39.25 
 
 
262 aa  182  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.4 
 
 
260 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  41.48 
 
 
259 aa  182  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  39.78 
 
 
258 aa  181  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  41.57 
 
 
257 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.53 
 
 
259 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  41.13 
 
 
257 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  41.13 
 
 
257 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.38 
 
 
258 aa  181  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  41.13 
 
 
257 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.46 
 
 
270 aa  180  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  38.17 
 
 
651 aa  180  2e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  40.53 
 
 
257 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1716  short chain enoyl-CoA hydratase  41.89 
 
 
260 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.923335  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  39.7 
 
 
257 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  39.69 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  39.69 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  42.21 
 
 
260 aa  179  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.87 
 
 
267 aa  179  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4190  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.38 
 
 
268 aa  179  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.164544  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  38.72 
 
 
263 aa  179  4.999999999999999e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.41 
 
 
256 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  41.18 
 
 
262 aa  178  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.44 
 
 
257 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  40.82 
 
 
260 aa  178  9e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  38.64 
 
 
260 aa  178  9e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  41.2 
 
 
251 aa  177  1e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  38.81 
 
 
260 aa  177  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  39.25 
 
 
257 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.17 
 
 
259 aa  176  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.25 
 
 
258 aa  177  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  40.38 
 
 
258 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.38 
 
 
258 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.3 
 
 
257 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  40.67 
 
 
260 aa  176  4e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00780  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  40.68 
 
 
260 aa  176  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0697189  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  38.66 
 
 
258 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.74 
 
 
259 aa  176  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.55 
 
 
258 aa  175  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.06 
 
 
258 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1795  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.93 
 
 
256 aa  175  7e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 
269 aa  175  7e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.89 
 
 
259 aa  175  9e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.81 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.91 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  40.6 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.93 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  40.53 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.93 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  40.37 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.74 
 
 
259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.62 
 
 
261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.93 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.11 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.38 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  37.36 
 
 
275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.43 
 
 
258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  38.95 
 
 
260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
257 aa  172  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0474  enoyl-CoA hydratase  38.81 
 
 
258 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.0000000000253276  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  38.19 
 
 
258 aa  172  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.78 
 
 
259 aa  172  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.71 
 
 
258 aa  172  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0449  enoyl-CoA hydratase  38.81 
 
 
258 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  38.26 
 
 
259 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  39.03 
 
 
258 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  38.49 
 
 
259 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0516  enoyl-CoA hydratase  38.06 
 
 
258 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195576  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.64 
 
 
267 aa  171  7.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>