More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2071 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
260 aa  520  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.2 
 
 
259 aa  348  5e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.65 
 
 
259 aa  338  7e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.62 
 
 
260 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60 
 
 
260 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.85 
 
 
260 aa  310  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1716  short chain enoyl-CoA hydratase  61 
 
 
260 aa  285  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.923335  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.12 
 
 
260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  49.81 
 
 
260 aa  250  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.42 
 
 
260 aa  249  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.62 
 
 
260 aa  249  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.67 
 
 
260 aa  245  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.08 
 
 
260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  48.82 
 
 
258 aa  240  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  49.24 
 
 
257 aa  238  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  47.49 
 
 
260 aa  236  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  47.1 
 
 
262 aa  235  5.0000000000000005e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.69 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.15 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  50.19 
 
 
257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  45.38 
 
 
260 aa  232  4.0000000000000004e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.67 
 
 
260 aa  232  5e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  48.65 
 
 
257 aa  231  8.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  48.08 
 
 
257 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  48.08 
 
 
257 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  47.69 
 
 
257 aa  229  3e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.83 
 
 
261 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  47.69 
 
 
257 aa  227  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  47.47 
 
 
260 aa  227  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.14 
 
 
257 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.49 
 
 
260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.29 
 
 
265 aa  225  5.0000000000000005e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.49 
 
 
260 aa  225  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  47.86 
 
 
260 aa  225  7e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  47.39 
 
 
258 aa  224  8e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  46.54 
 
 
258 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  46.33 
 
 
260 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  48.99 
 
 
258 aa  223  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.69 
 
 
260 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.62 
 
 
261 aa  222  6e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.77 
 
 
258 aa  221  6e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.85 
 
 
258 aa  221  7e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  43.85 
 
 
258 aa  221  7e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.85 
 
 
258 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.46 
 
 
258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  44.02 
 
 
257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.97 
 
 
257 aa  218  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.58 
 
 
257 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.58 
 
 
257 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.24 
 
 
258 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45 
 
 
257 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.37 
 
 
265 aa  217  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  45.17 
 
 
259 aa  217  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.39 
 
 
259 aa  217  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.14 
 
 
257 aa  217  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  49.22 
 
 
256 aa  216  2e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.19 
 
 
257 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  43.08 
 
 
258 aa  217  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  46.54 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  47.1 
 
 
261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  43.46 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.23 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  42.41 
 
 
260 aa  215  5e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  44.62 
 
 
260 aa  215  5e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.46 
 
 
258 aa  215  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.36 
 
 
267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  45 
 
 
258 aa  215  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.54 
 
 
268 aa  214  8e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  45.98 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.05 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  44.06 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  44.62 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  46.92 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0471  enoyl-CoA hydratase  46.54 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000928124  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4606  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.97 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  42.02 
 
 
260 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.23 
 
 
259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.31 
 
 
262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.67 
 
 
267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2688  enoyl-CoA hydratase  46.15 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000000387614  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  41.8 
 
 
259 aa  212  3.9999999999999995e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3631  enoyl-CoA hydratase  46.92 
 
 
258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251765  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  46.54 
 
 
258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.11 
 
 
256 aa  212  5.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0474  enoyl-CoA hydratase  45.77 
 
 
258 aa  211  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.0000000000253276  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0449  enoyl-CoA hydratase  45.77 
 
 
258 aa  211  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.15 
 
 
262 aa  211  7.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0516  enoyl-CoA hydratase  45.77 
 
 
258 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195576  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.06 
 
 
260 aa  211  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  42.63 
 
 
260 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.42 
 
 
265 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.38 
 
 
259 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  45.6 
 
 
259 aa  210  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  45.2 
 
 
277 aa  210  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  43.63 
 
 
260 aa  210  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.2 
 
 
259 aa  210  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  44.96 
 
 
257 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  43.58 
 
 
257 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.236024  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.77 
 
 
259 aa  209  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  44.96 
 
 
257 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>