More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1716 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1716  short chain enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 260 aa  521  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.923335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  71.92 
 
 		 260 aa  378  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  69.62 
 
 		 260 aa  355  2.9999999999999997e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  69.62 
 
 		 260 aa  354  6.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  61 
 
 		 260 aa  306  3e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.75 
 
 		 259 aa  298  7e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.98 
 
 		 259 aa  294  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.85 
 
 		 260 aa  264  8.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  50.78 
 
 		 258 aa  261  6e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.67 
 
 		 260 aa  260  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.75 
 
 		 260 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.92 
 
 		 260 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.77 
 
 		 260 aa  252  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.77 
 
 		 260 aa  252  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  49.23 
 
 		 260 aa  251  8.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  50.38 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.11 
 
 		 260 aa  248  6e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.26 
 
 		 260 aa  247  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  48.46 
 
 		 260 aa  247  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  48.46 
 
 		 260 aa  247  1e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  49.23 
 
 		 260 aa  248  1e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  48.46 
 
 		 260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  53.31 
 
 		 256 aa  241  9e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.51 
 
 		 265 aa  240  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.38 
 
 		 267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.69 
 
 		 260 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  47.69 
 
 		 260 aa  238  8e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  49.4 
 
 		 262 aa  237  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  51.15 
 
 		 257 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  49.4 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  50.99 
 
 		 260 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 		 269 aa  229  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  50.38 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  46.54 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.4 
 
 		 265 aa  228  6e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.69 
 
 		 259 aa  228  6e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  49.62 
 
 		 257 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.88 
 
 		 259 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.77 
 
 		 260 aa  226  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  45.77 
 
 		 257 aa  225  6e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.74 
 
 		 261 aa  224  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  46.69 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.29 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  45.53 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  45.38 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  46.69 
 
 		 258 aa  223  3e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  46.92 
 
 		 259 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  49.19 
 
 		 258 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  43.85 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.38 
 
 		 264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  46.01 
 
 		 257 aa  218  7e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  46.01 
 
 		 257 aa  218  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  46.01 
 
 		 257 aa  218  7e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.1 
 
 		 268 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  44.23 
 
 		 257 aa  217  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  43.73 
 
 		 257 aa  216  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.91 
 
 		 261 aa  216  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  44.87 
 
 		 257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  46.18 
 
 		 260 aa  215  5e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.12 
 
 		 253 aa  215  5e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.53 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  45.98 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  45.59 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1316  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.27 
 
 		 260 aa  212  3.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.200035  normal  0.304816 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.24 
 
 		 258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.73 
 
 		 263 aa  212  5.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3055  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.15 
 
 		 260 aa  212  5.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.15 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.49 
 
 		 259 aa  210  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.22 
 
 		 257 aa  211  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.31 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.19 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.56 
 
 		 257 aa  209  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.13 
 
 		 260 aa  209  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.8 
 
 		 256 aa  209  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  47.43 
 
 		 257 aa  209  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.23 
 
 		 257 aa  208  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  43.35 
 
 		 258 aa  208  8e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.85 
 
 		 258 aa  207  9e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.85 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.85 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.77 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.28 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  44.06 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.3 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.85 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  44.7 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.79 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.75 
 
 		 258 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  44.62 
 
 		 257 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  42.75 
 
 		 258 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.15 
 
 		 261 aa  206  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.02 
 
 		 258 aa  205  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  44.02 
 
 		 261 aa  205  7e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  43.89 
 
 		 258 aa  204  9e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  43.73 
 
 		 258 aa  204  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  43.63 
 
 		 259 aa  204  9e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00780  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  44.23 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0697189  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.97 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>