More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3078 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
263 aa  534  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  73.36 
 
 
262 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  72.2 
 
 
262 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  71.81 
 
 
262 aa  365  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  71.81 
 
 
262 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  64.2 
 
 
263 aa  341  8e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  58.91 
 
 
263 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  64.26 
 
 
262 aa  322  3e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  59.3 
 
 
263 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  58.91 
 
 
263 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  58.91 
 
 
263 aa  314  9e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  63.16 
 
 
261 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  58.94 
 
 
263 aa  295  5e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  56.2 
 
 
262 aa  295  5e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  60 
 
 
276 aa  294  8e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  55.73 
 
 
280 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  57.94 
 
 
263 aa  290  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  56.3 
 
 
263 aa  289  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  52.85 
 
 
262 aa  289  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  57.54 
 
 
263 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  57.54 
 
 
263 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  57.54 
 
 
263 aa  288  9e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  57.54 
 
 
263 aa  288  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  57.54 
 
 
263 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  57.54 
 
 
263 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  57.54 
 
 
263 aa  288  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  52.51 
 
 
260 aa  281  6.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  55.04 
 
 
263 aa  280  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0681  enoyl-CoA hydratase  60.23 
 
 
263 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  52.16 
 
 
264 aa  268  5e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  49.42 
 
 
264 aa  268  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  59.2 
 
 
263 aa  264  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  57.54 
 
 
263 aa  261  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  57.94 
 
 
263 aa  261  6e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  57.94 
 
 
263 aa  261  6e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2691  enoyl-CoA hydratase  57.69 
 
 
263 aa  261  8e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103859  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  57.54 
 
 
263 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2873  enoyl-CoA hydratase  56.44 
 
 
262 aa  260  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00237837  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0471  enoyl-CoA hydratase  58.06 
 
 
263 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0802767  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  53.49 
 
 
261 aa  257  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0446  enoyl-CoA hydratase  57.31 
 
 
263 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.67 
 
 
257 aa  256  3e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  46.77 
 
 
261 aa  255  4e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2853  enoyl-CoA hydratase  56.64 
 
 
263 aa  255  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00948295  normal  0.659081 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3115  enoyl-CoA hydratase  55.68 
 
 
262 aa  254  7e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000284376  normal  0.0714988 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2750  enoyl-CoA hydratase  55.68 
 
 
262 aa  254  9e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00030401  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3363  enoyl-CoA hydratase  61.98 
 
 
261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3488  enoyl-CoA hydratase  59.2 
 
 
263 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000267739 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  48.06 
 
 
261 aa  246  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3015  enoyl-CoA hydratase  54.37 
 
 
274 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2405  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.41 
 
 
272 aa  239  4e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1238  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.43 
 
 
267 aa  235  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  44.49 
 
 
263 aa  224  9e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  52.47 
 
 
263 aa  223  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0984  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  51.13 
 
 
266 aa  223  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.74 
 
 
270 aa  223  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.19 
 
 
259 aa  221  9e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  43.87 
 
 
266 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  44.27 
 
 
266 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  47.01 
 
 
266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0568  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.7 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1130  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  47.53 
 
 
259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.82 
 
 
260 aa  212  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  43.08 
 
 
266 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1715  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.82 
 
 
264 aa  210  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2154  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  45.69 
 
 
258 aa  207  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182629  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  44.49 
 
 
267 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  41.83 
 
 
264 aa  205  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  43.92 
 
 
284 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1753  enoyl-CoA hydratase  46.39 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.228549 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.17 
 
 
263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0214768  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.21 
 
 
258 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372212  normal  0.332854 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.97 
 
 
258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.886446  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.06 
 
 
256 aa  195  8.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.38 
 
 
264 aa  193  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.13 
 
 
255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.02 
 
 
267 aa  189  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.3 
 
 
259 aa  186  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.75 
 
 
257 aa  185  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8421  enoyl-CoA hydratase  47.01 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1797  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.49 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  41.44 
 
 
260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4359  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.64 
 
 
268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1985  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.43 
 
 
266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.2 
 
 
260 aa  182  6e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.72 
 
 
273 aa  180  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1747  enoyl-CoA hydratase  41 
 
 
272 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1813  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41 
 
 
272 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1766  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41 
 
 
272 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.77 
 
 
265 aa  179  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4089  enoyl-CoA hydratase  40.77 
 
 
251 aa  178  9e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.83 
 
 
268 aa  177  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2150  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.83 
 
 
274 aa  177  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00228605  normal  0.0108638 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06370  Enoyl-CoA hydratase  45.28 
 
 
283 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.622554  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.77 
 
 
270 aa  176  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0654  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.39 
 
 
263 aa  176  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3979  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.26 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  38.37 
 
 
265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  37.64 
 
 
262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3726  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.31 
 
 
258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>