More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0468 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
263 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3488  enoyl-CoA hydratase  97.72 
 
 
263 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000267739 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  82.51 
 
 
263 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  82.51 
 
 
263 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  82.51 
 
 
263 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  82.51 
 
 
263 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  82.51 
 
 
263 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  81.75 
 
 
263 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  82.51 
 
 
263 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  82.51 
 
 
263 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2691  enoyl-CoA hydratase  89.73 
 
 
263 aa  443  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103859  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  84.03 
 
 
263 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  82.89 
 
 
263 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2853  enoyl-CoA hydratase  82.89 
 
 
263 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00948295  normal  0.659081 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  81.37 
 
 
263 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  81.37 
 
 
263 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0471  enoyl-CoA hydratase  82.51 
 
 
263 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0802767  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0446  enoyl-CoA hydratase  81.75 
 
 
263 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  78.54 
 
 
280 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3015  enoyl-CoA hydratase  78.31 
 
 
274 aa  352  2.9999999999999997e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2750  enoyl-CoA hydratase  69.69 
 
 
262 aa  332  5e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00030401  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3115  enoyl-CoA hydratase  69.29 
 
 
262 aa  332  5e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000284376  normal  0.0714988 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2873  enoyl-CoA hydratase  69.29 
 
 
262 aa  325  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00237837  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  63.4 
 
 
264 aa  325  7e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  63.26 
 
 
263 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  59.62 
 
 
264 aa  315  5e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  58.11 
 
 
263 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  60 
 
 
263 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  60.63 
 
 
261 aa  305  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  60 
 
 
263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  59.25 
 
 
263 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  56.44 
 
 
263 aa  293  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  61.94 
 
 
263 aa  292  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  63.27 
 
 
276 aa  291  6e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  58.63 
 
 
263 aa  276  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  59.6 
 
 
262 aa  271  7e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  56.8 
 
 
262 aa  270  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  59.2 
 
 
262 aa  269  4e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  55.16 
 
 
260 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  59.2 
 
 
262 aa  266  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  59.2 
 
 
262 aa  266  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  59.2 
 
 
263 aa  265  7e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  51.98 
 
 
262 aa  260  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0681  enoyl-CoA hydratase  60.32 
 
 
263 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  52.03 
 
 
261 aa  248  9e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1238  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.52 
 
 
267 aa  246  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.76 
 
 
257 aa  246  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  56 
 
 
262 aa  245  6e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  46.85 
 
 
261 aa  238  5e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3363  enoyl-CoA hydratase  61.63 
 
 
261 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0568  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.86 
 
 
260 aa  235  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  46.21 
 
 
263 aa  235  6e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2405  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.23 
 
 
272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0984  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  57.42 
 
 
266 aa  232  6e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49 
 
 
270 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  50.2 
 
 
261 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.66 
 
 
267 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1130  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  48.67 
 
 
259 aa  221  8e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  53.58 
 
 
263 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  46.04 
 
 
284 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.66 
 
 
259 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3979  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.91 
 
 
256 aa  212  5.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1753  enoyl-CoA hydratase  48.29 
 
 
258 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.228549 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  44.53 
 
 
267 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  42.75 
 
 
266 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  43.12 
 
 
266 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2154  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  49.05 
 
 
258 aa  209  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182629  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.67 
 
 
258 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372212  normal  0.332854 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  45.9 
 
 
260 aa  206  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  43.07 
 
 
264 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.15 
 
 
258 aa  205  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.886446  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  41.64 
 
 
266 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.56 
 
 
260 aa  201  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.08 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.92 
 
 
263 aa  198  6e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0214768  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  46.3 
 
 
266 aa  198  6e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1715  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.9 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3942  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.59 
 
 
277 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.908952  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.6 
 
 
259 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.94 
 
 
264 aa  180  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 
265 aa  180  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.83 
 
 
268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.68 
 
 
257 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.86 
 
 
271 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.46 
 
 
271 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.73 
 
 
271 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.39 
 
 
273 aa  176  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.78 
 
 
258 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.08 
 
 
255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.41 
 
 
265 aa  172  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 
274 aa  172  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0444  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.27 
 
 
268 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1836  enoyl-CoA hydratase  43.24 
 
 
270 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.395714  normal  0.321075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3726  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.57 
 
 
258 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452007  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8421  enoyl-CoA hydratase  46.18 
 
 
261 aa  168  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.44 
 
 
267 aa  167  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2188  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.39 
 
 
255 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.000498969  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.75 
 
 
262 aa  168  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.78 
 
 
261 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>