More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0681 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0681  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 263 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  73.28 
 
 		 263 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  64.86 
 
 		 261 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  67.83 
 
 		 276 aa  327  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  59.7 
 
 		 263 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  60.69 
 
 		 263 aa  308  5e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  59.32 
 
 		 263 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  59.92 
 
 		 263 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  60.38 
 
 		 263 aa  303  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  59.32 
 
 		 263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  60.73 
 
 		 263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  60.73 
 
 		 263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  60.73 
 
 		 263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  60.73 
 
 		 263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  60.73 
 
 		 263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  60.73 
 
 		 263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  60.73 
 
 		 263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  59 
 
 		 262 aa  301  7.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  56.11 
 
 		 263 aa  297  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  59.76 
 
 		 280 aa  297  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  59.23 
 
 		 262 aa  292  4e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  55.81 
 
 		 260 aa  290  2e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  58.85 
 
 		 262 aa  290  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  58.46 
 
 		 262 aa  285  4e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  58.46 
 
 		 262 aa  285  4e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  53.99 
 
 		 263 aa  285  5e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  60.23 
 
 		 263 aa  285  5e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3363  enoyl-CoA hydratase  66.93 
 
 		 261 aa  275  8e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  57.53 
 
 		 262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2691  enoyl-CoA hydratase  61.13 
 
 		 263 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  60.32 
 
 		 263 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  60.32 
 
 		 263 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0471  enoyl-CoA hydratase  60.73 
 
 		 263 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0802767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0446  enoyl-CoA hydratase  57.58 
 
 		 263 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  58.4 
 
 		 263 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  58.4 
 
 		 263 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  51.14 
 
 		 264 aa  266  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  58.4 
 
 		 263 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  49.81 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2853  enoyl-CoA hydratase  57.2 
 
 		 263 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00948295  normal  0.659081 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  54.02 
 
 		 261 aa  263  3e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3488  enoyl-CoA hydratase  60.32 
 
 		 263 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000267739 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2873  enoyl-CoA hydratase  56.11 
 
 		 262 aa  256  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00237837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3015  enoyl-CoA hydratase  56.87 
 
 		 274 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2750  enoyl-CoA hydratase  55.73 
 
 		 262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00030401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3115  enoyl-CoA hydratase  55.34 
 
 		 262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000284376  normal  0.0714988 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  51.92 
 
 		 261 aa  249  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  49.05 
 
 		 262 aa  248  6e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  44.36 
 
 		 261 aa  235  5.0000000000000005e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0568  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.44 
 
 		 260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  44.66 
 
 		 263 aa  222  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.15 
 
 		 270 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.58 
 
 		 257 aa  220  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1238  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.31 
 
 		 267 aa  218  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.03 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  51.71 
 
 		 263 aa  216  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2154  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  48.85 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0984  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  51.13 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2405  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.37 
 
 		 272 aa  211  9e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.44 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1715  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.89 
 
 		 264 aa  209  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1130  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  47.04 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  42.59 
 
 		 284 aa  204  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.24 
 
 		 263 aa  202  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0214768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.09 
 
 		 258 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.886446  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.95 
 
 		 258 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372212  normal  0.332854 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.08 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  41.11 
 
 		 266 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.44 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  41.89 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1753  enoyl-CoA hydratase  47.71 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.228549 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  46.99 
 
 		 266 aa  195  7e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  40.37 
 
 		 266 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  42.7 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  40.3 
 
 		 266 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3726  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.9 
 
 		 258 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452007  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3979  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.43 
 
 		 256 aa  192  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.48 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  41.98 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  41.91 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  40.84 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0654  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.35 
 
 		 263 aa  176  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1797  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.05 
 
 		 261 aa  176  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.8 
 
 		 268 aa  175  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3942  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.29 
 
 		 277 aa  172  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.908952  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  41.98 
 
 		 265 aa  171  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06370  Enoyl-CoA hydratase  45.38 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.622554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.31 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.98 
 
 		 273 aa  169  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  38.52 
 
 		 265 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0433  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 		 249 aa  168  8e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.84 
 
 		 259 aa  168  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2188  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.1 
 
 		 255 aa  168  8e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.000498969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.28 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8421  enoyl-CoA hydratase  45.42 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.36 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  39.18 
 
 		 269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.49 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.77 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  39.38 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>