More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0485 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 261 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  91.22 
 
 		 262 aa  480  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0555  enoyl-CoA hydratase  92.75 
 
 		 262 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.323488  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  81.4 
 
 		 264 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  41.67 
 
 		 262 aa  182  6e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.55 
 
 		 264 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  39.15 
 
 		 263 aa  178  9e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.62 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.11 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  39.62 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0852  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.63 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.938482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.49 
 
 		 255 aa  166  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  41.22 
 
 		 261 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  38.62 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  39.69 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2517  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 255 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.6 
 
 		 257 aa  161  9e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  40.3 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.3 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  37.88 
 
 		 262 aa  160  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.11 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.8 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  38.96 
 
 		 659 aa  159  3e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  35.2 
 
 		 259 aa  159  3e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.18 
 
 		 260 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  37.88 
 
 		 262 aa  159  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  40.32 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  40.32 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  40.32 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  40.32 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  40.32 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  40.32 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  39.85 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  40.32 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1007  enoyl-CoA hydratase  36.58 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0394132  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  39.53 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6848  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  35.52 
 
 		 263 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19430  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  39.62 
 
 		 271 aa  155  6e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0126218 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0903  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.15 
 
 		 270 aa  155  8e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.048792  normal  0.959739 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  37.5 
 
 		 262 aa  155  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 		 262 aa  155  9e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.94 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  35.6 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.02 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  40.24 
 
 		 276 aa  152  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.93 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.85 
 
 		 273 aa  152  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.2 
 
 		 273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0654  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.1 
 
 		 263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2068  enoyl-CoA hydratase  43.6 
 
 		 259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.847679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0194  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.92 
 
 		 265 aa  151  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0501  enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  34.62 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.96 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.4 
 
 		 268 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 		 266 aa  149  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  34.62 
 
 		 263 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  34.62 
 
 		 258 aa  149  5e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 		 257 aa  149  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 		 262 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 		 269 aa  149  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5145  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.44 
 
 		 260 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.149843 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  34.62 
 
 		 258 aa  148  7e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  34.34 
 
 		 264 aa  148  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0681  enoyl-CoA hydratase  41.98 
 
 		 263 aa  148  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 		 262 aa  148  8e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  34.62 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.5 
 
 		 260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.05 
 
 		 287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0330  enoyl-CoA hydratase  34.22 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150618  hitchhiker  0.00796667 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1205  enoyl-CoA hydratase  41.38 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.755368  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3447  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.31 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 		 267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  32.7 
 
 		 261 aa  145  5e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 		 273 aa  145  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.7 
 
 		 261 aa  145  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2540  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.1 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.893236  normal  0.33655 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  41.02 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 		 261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  34.34 
 
 		 265 aa  145  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.97 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  38.28 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.05 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 		 264 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  34.56 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  36.74 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8421  enoyl-CoA hydratase  40.29 
 
 		 261 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.23 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2114  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.25 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.94 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>