More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0555 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0555  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 262 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.323488  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  94.66 
 
 		 261 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  90.08 
 
 		 262 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  80.23 
 
 		 264 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.4 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  40.91 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.17 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.08 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  39.62 
 
 		 260 aa  175  8e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  37.98 
 
 		 263 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0852  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.39 
 
 		 265 aa  168  6e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.938482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.39 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.59 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.05 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.78 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.48 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  39.45 
 
 		 260 aa  165  9e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  38.62 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38 
 
 		 257 aa  162  7e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.97 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  39.77 
 
 		 261 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  39.47 
 
 		 263 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1007  enoyl-CoA hydratase  35.91 
 
 		 268 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0394132  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.1 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2517  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.85 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 		 266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  37.75 
 
 		 659 aa  155  6e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0903  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.54 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.048792  normal  0.959739 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  34 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  39.85 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  35 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  39.02 
 
 		 261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19430  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  39.77 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0126218 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 		 267 aa  152  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  35 
 
 		 258 aa  152  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  37.88 
 
 		 261 aa  152  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.6 
 
 		 267 aa  152  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 		 262 aa  152  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5145  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.84 
 
 		 260 aa  152  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.149843 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 		 262 aa  150  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6848  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.31 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  33.96 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.08 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.02 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.52 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 		 262 aa  150  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  34.75 
 
 		 263 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  39 
 
 		 276 aa  149  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.4 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2068  enoyl-CoA hydratase  42.8 
 
 		 259 aa  149  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.847679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0501  enoyl-CoA hydratase  42.06 
 
 		 263 aa  149  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 		 260 aa  149  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3834  enoyl-CoA hydratase  36.15 
 
 		 262 aa  148  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.5 
 
 		 260 aa  148  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 		 265 aa  148  9e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  39.29 
 
 		 266 aa  148  9e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.97 
 
 		 273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  33.96 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0194  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.7 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  35.98 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  41.02 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  35.98 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2583  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.601041  normal  0.0270036 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.94 
 
 		 261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 		 258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 		 269 aa  145  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  35.11 
 
 		 263 aa  145  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0330  enoyl-CoA hydratase  34.22 
 
 		 260 aa  145  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150618  hitchhiker  0.00796667 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0654  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.22 
 
 		 263 aa  145  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.81 
 
 		 258 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3447  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.54 
 
 		 261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.12 
 
 		 262 aa  145  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2378  enoyl-CoA hydratase  35.96 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.84 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.02 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2114  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.25 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  34.19 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0151  enoyl-CoA hydratase  34.75 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1205  enoyl-CoA hydratase  39.39 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.755368  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.64 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.22 
 
 		 260 aa  142  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  32.58 
 
 		 266 aa  142  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8421  enoyl-CoA hydratase  39.93 
 
 		 261 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1747  enoyl-CoA hydratase  36 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06370  Enoyl-CoA hydratase  41.13 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.622554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1993  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  36.84 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1813  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.591825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>