More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0330 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0330  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
260 aa  522  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150618  hitchhiker  0.00796667 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3834  enoyl-CoA hydratase  59.3 
 
 
262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0893  enoyl-CoA hydratase  56.08 
 
 
271 aa  246  4e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0782068  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1007  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.61 
 
 
276 aa  243  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57099  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4068  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.64 
 
 
267 aa  232  5e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0026  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.53 
 
 
262 aa  231  6e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.43 
 
 
270 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6738  enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
262 aa  218  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.15 
 
 
264 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.38 
 
 
264 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0278  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  42.4 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.46 
 
 
263 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 
263 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0407  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.8 
 
 
271 aa  166  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.85 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.3 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  35.97 
 
 
263 aa  162  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  38.28 
 
 
266 aa  163  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 
260 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19430  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.45 
 
 
271 aa  159  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0126218 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  36.23 
 
 
266 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1205  enoyl-CoA hydratase  37.26 
 
 
264 aa  158  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.755368  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3447  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.23 
 
 
261 aa  155  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  35.85 
 
 
266 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  36.6 
 
 
266 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 
263 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  33.58 
 
 
263 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1836  enoyl-CoA hydratase  37.13 
 
 
270 aa  153  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.395714  normal  0.321075 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
263 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  31.33 
 
 
260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 
264 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 
263 aa  150  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.41 
 
 
267 aa  151  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  36.82 
 
 
263 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  36.82 
 
 
263 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  36.82 
 
 
263 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  36.82 
 
 
263 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  36.82 
 
 
263 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  36.82 
 
 
263 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  36.82 
 
 
263 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  28.85 
 
 
261 aa  150  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 
264 aa  149  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.5 
 
 
262 aa  149  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  32.83 
 
 
263 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  33.84 
 
 
262 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3600  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  34.22 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  32.06 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  36.51 
 
 
263 aa  145  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  34.72 
 
 
263 aa  145  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  31.47 
 
 
259 aa  144  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.03 
 
 
259 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  35.52 
 
 
262 aa  144  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
284 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  34.75 
 
 
261 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.38 
 
 
273 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  33.84 
 
 
264 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.2 
 
 
265 aa  142  4e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  35.23 
 
 
263 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 
263 aa  142  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 
259 aa  142  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.11 
 
 
256 aa  141  9e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.99 
 
 
270 aa  140  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  29.81 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3395  enoyl-CoA hydratase  36.58 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.428446 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3344  enoyl-CoA hydratase  36.58 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.875578  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  31.8 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3333  enoyl-CoA hydratase  36.58 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0320985  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 
261 aa  139  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.68 
 
 
258 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372212  normal  0.332854 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  31.54 
 
 
262 aa  139  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0895  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.52 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  35.91 
 
 
261 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.94 
 
 
273 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.67 
 
 
270 aa  138  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  32.57 
 
 
260 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.6 
 
 
261 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  34.09 
 
 
265 aa  137  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.23 
 
 
260 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7944  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.16 
 
 
261 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  32.08 
 
 
265 aa  137  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.41 
 
 
659 aa  137  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  33.84 
 
 
264 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06370  Enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
283 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.622554  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.99 
 
 
261 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  34.35 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.63 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5520  enoyl-CoA hydratase  35.18 
 
 
275 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181326 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 
263 aa  135  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 
262 aa  135  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.45 
 
 
255 aa  135  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.35 
 
 
264 aa  135  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1259  enoyl-CoA hydratase  38.27 
 
 
250 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  34.77 
 
 
263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.81 
 
 
662 aa  135  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.75 
 
 
661 aa  135  9e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  34.77 
 
 
263 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>