More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0895 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0895  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 260 aa  494  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3203  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.87 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.15 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  38.02 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.98 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  38.08 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  38.08 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  38.08 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  37.31 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  38.08 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  38.08 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  38.08 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  38.08 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  38.52 
 
 		 280 aa  142  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3600  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.54 
 
 		 263 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0330  enoyl-CoA hydratase  35.52 
 
 		 260 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150618  hitchhiker  0.00796667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  38.55 
 
 		 262 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.52 
 
 		 261 aa  138  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  29.23 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  35.11 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3447  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.24 
 
 		 261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  36.26 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  32.2 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3344  enoyl-CoA hydratase  38.58 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.875578  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3395  enoyl-CoA hydratase  38.58 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.428446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3333  enoyl-CoA hydratase  38.58 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0320985  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  37.15 
 
 		 263 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3834  enoyl-CoA hydratase  36.05 
 
 		 262 aa  132  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0407  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.64 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  33.97 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  37.93 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 		 263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 		 266 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 		 263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3074  enoyl-CoA hydratase  39.15 
 
 		 259 aa  125  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.438206 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 		 262 aa  125  9e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  36.92 
 
 		 264 aa  125  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1259  enoyl-CoA hydratase  40.89 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2691  enoyl-CoA hydratase  38.28 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  37.79 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  37.31 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  38.08 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2240  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 		 272 aa  122  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0555  enoyl-CoA hydratase  39.46 
 
 		 262 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.323488  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1007  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.11 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57099  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0026  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.72 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  36.15 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2853  enoyl-CoA hydratase  37.31 
 
 		 263 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00948295  normal  0.659081 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0446  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0312  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.305978  normal  0.0108987 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.05 
 
 		 261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0471  enoyl-CoA hydratase  37.19 
 
 		 263 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0802767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.8 
 
 		 270 aa  119  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.82 
 
 		 264 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  0.988887 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  34.12 
 
 		 260 aa  119  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  34.1 
 
 		 264 aa  118  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  32.54 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4526  enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3326  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.76 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4068  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.11 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.68 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0228  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.08 
 
 		 279 aa  116  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 		 263 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0840  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 		 273 aa  115  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0193834  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 		 263 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 		 263 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  36.84 
 
 		 263 aa  115  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0352  enoyl-CoA hydratase  32.41 
 
 		 254 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2188  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.000498969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0367  enoyl-CoA hydratase  32.02 
 
 		 254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.78 
 
 		 273 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0388  enoyl-CoA hydratase  32.26 
 
 		 254 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.42322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  32.58 
 
 		 264 aa  115  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  34.35 
 
 		 265 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1594  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.7 
 
 		 263 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 		 264 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2835  putative enoyl-CoA hydratase  35 
 
 		 261 aa  115  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0450  enoyl-CoA hydratase  30.04 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  37.09 
 
 		 276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0413  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 		 251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613857  normal  0.169289 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1462  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.59 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.09 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4089  enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6738  enoyl-CoA hydratase  37.25 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.32 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  31.66 
 
 		 262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  34.87 
 
 		 262 aa  112  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 		 262 aa  112  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>