More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0228 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0228  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
279 aa  559  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5145  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.52 
 
 
260 aa  169  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.149843 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2583  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.66 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.601041  normal  0.0270036 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  37.7 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0194  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.11 
 
 
265 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1594  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.8 
 
 
263 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.02 
 
 
287 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
259 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  38.2 
 
 
264 aa  155  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.2 
 
 
264 aa  155  8e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  40.47 
 
 
265 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.98 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  0.988887 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 
264 aa  152  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 
265 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.86 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  35.8 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.6 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4549  enoyl-CoA hydratase  39.75 
 
 
276 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.23 
 
 
256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1985  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.84 
 
 
266 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  34.48 
 
 
262 aa  145  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4185  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 
267 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5501  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
264 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  35.23 
 
 
262 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 
266 aa  142  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.13 
 
 
267 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 
270 aa  142  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1813  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.26 
 
 
272 aa  141  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 
267 aa  142  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1766  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.26 
 
 
272 aa  141  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1747  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.25 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.98 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.25 
 
 
267 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  35.11 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.98 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.88 
 
 
273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 
268 aa  139  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.83 
 
 
258 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.93 
 
 
273 aa  138  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  34.59 
 
 
263 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 
264 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  31.62 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.41 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  34.47 
 
 
263 aa  135  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4597  enoyl-CoA hydratase  35.11 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  33.72 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.58 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.82 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  39.29 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  33.73 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.55 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
263 aa  133  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 
262 aa  133  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 
262 aa  133  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3395  enoyl-CoA hydratase  36.5 
 
 
259 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.428446 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3344  enoyl-CoA hydratase  36.5 
 
 
259 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.875578  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3333  enoyl-CoA hydratase  36.5 
 
 
259 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0320985  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.83 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  32.8 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  36.64 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.55 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  37.02 
 
 
262 aa  130  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  37.02 
 
 
262 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  34.44 
 
 
263 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  33.72 
 
 
266 aa  130  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  34.19 
 
 
263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1007  enoyl-CoA hydratase  31.73 
 
 
268 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0394132  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4553  enoyl-CoA hydratase  34.36 
 
 
261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0511055  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 
256 aa  129  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4068  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 
267 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 
264 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
264 aa  128  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  34.47 
 
 
261 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  32.8 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  34.1 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4359  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 
268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  34.81 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2517  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.6 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  35.18 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  32.32 
 
 
264 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  37.8 
 
 
263 aa  126  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 
255 aa  126  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.56 
 
 
259 aa  126  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 
271 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  36.92 
 
 
263 aa  126  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  32.53 
 
 
259 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0054  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 
270 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  36.88 
 
 
266 aa  125  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1598  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
261 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>