More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1132 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 264 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  0.988887 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1594  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  84.03 
 
 		 263 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4185  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.51 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.91 
 
 		 267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.94 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0228  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.98 
 
 		 279 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  37.75 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.89 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  37.7 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.16 
 
 		 264 aa  161  9e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4549  enoyl-CoA hydratase  43.22 
 
 		 276 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2583  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.96 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.601041  normal  0.0270036 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  37.69 
 
 		 266 aa  158  8e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.25 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5145  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.149843 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0194  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.46 
 
 		 265 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1655  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.96 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.14 
 
 		 267 aa  149  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  39.2 
 
 		 262 aa  149  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.96 
 
 		 258 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  35.66 
 
 		 262 aa  149  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1007  enoyl-CoA hydratase  36.5 
 
 		 268 aa  148  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0394132  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  36.74 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19110  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.16 
 
 		 280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.184392  normal  0.138145 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.01 
 
 		 258 aa  145  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.84 
 
 		 267 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3600  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.04 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.96 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6880  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.21 
 
 		 270 aa  143  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  37.64 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  37.14 
 
 		 264 aa  142  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0814  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 		 262 aa  142  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134124  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 		 260 aa  142  5e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 		 257 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  34.77 
 
 		 257 aa  141  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.98 
 
 		 257 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3726  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.21 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452007  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.98 
 
 		 257 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  33.98 
 
 		 269 aa  140  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  32.43 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.25 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4597  enoyl-CoA hydratase  38.98 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  36.86 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.98 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1747  enoyl-CoA hydratase  36.09 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5501  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1813  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 		 272 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 		 258 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1766  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 		 272 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0344  enoyl-CoA hydratase  34.52 
 
 		 256 aa  139  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.458261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0176  short chain enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.212196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3447  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.43 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 		 258 aa  139  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 		 259 aa  139  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0382  short chain enoyl-CoA hydratase  34.65 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.123728  hitchhiker  0.00785699 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.19 
 
 		 266 aa  138  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 		 258 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  31.94 
 
 		 270 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.08 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.72 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6846  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.84 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  36.21 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  31.25 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.65 
 
 		 259 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  36.18 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.65 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 		 261 aa  137  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  31.56 
 
 		 270 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6847  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 		 268 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  36.03 
 
 		 263 aa  135  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 		 263 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  35.41 
 
 		 257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  32.06 
 
 		 275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  30.68 
 
 		 262 aa  135  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0330  enoyl-CoA hydratase  33.98 
 
 		 260 aa  135  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150618  hitchhiker  0.00796667 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  34.25 
 
 		 258 aa  135  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.45 
 
 		 268 aa  135  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.1 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.25 
 
 		 259 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6848  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.96 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  34.48 
 
 		 262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  35.41 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1985  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  34.65 
 
 		 258 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  36.68 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  35.43 
 
 		 258 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  33.99 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>