More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1007 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1007  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
268 aa  545  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0394132  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  80.38 
 
 
267 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  74.51 
 
 
263 aa  396  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  70.75 
 
 
260 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4597  enoyl-CoA hydratase  72.16 
 
 
270 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  67.73 
 
 
258 aa  358  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.04 
 
 
287 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5145  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
260 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.149843 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4549  enoyl-CoA hydratase  40.87 
 
 
276 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 
259 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 
273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 
264 aa  159  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4044  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
267 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.24 
 
 
264 aa  158  7e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  40.24 
 
 
264 aa  158  9e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.22 
 
 
267 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  37.21 
 
 
262 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  36.58 
 
 
261 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2583  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.08 
 
 
269 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.601041  normal  0.0270036 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0194  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 
265 aa  155  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  36.58 
 
 
263 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  35.89 
 
 
261 aa  154  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.8 
 
 
266 aa  153  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5501  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 
264 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5507  enoyl-CoA hydratase  37.1 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5354  enoyl-CoA hydratase  37.1 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.75 
 
 
264 aa  152  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4765  enoyl-CoA hydratase  37.25 
 
 
260 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991647  normal  0.447028 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  35.46 
 
 
260 aa  151  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  34.25 
 
 
262 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  35.41 
 
 
259 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  34.82 
 
 
263 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  36.61 
 
 
263 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0151  enoyl-CoA hydratase  36.03 
 
 
260 aa  149  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2540  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 
263 aa  149  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.893236  normal  0.33655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1594  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
263 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 
263 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.57 
 
 
261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.82 
 
 
266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  36.61 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  36.61 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  36.61 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.75 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  36.61 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  36.61 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  36.61 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  36.61 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.43 
 
 
257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  35.8 
 
 
263 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.54 
 
 
255 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  31.58 
 
 
265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  34.09 
 
 
266 aa  145  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 
267 aa  145  9e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.96 
 
 
267 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  35.91 
 
 
263 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.83 
 
 
271 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4185  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.99 
 
 
267 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 
260 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.83 
 
 
271 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 
271 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.43 
 
 
264 aa  142  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 
262 aa  142  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0555  enoyl-CoA hydratase  35.91 
 
 
262 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.323488  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  37.8 
 
 
280 aa  142  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.54 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.72 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6511  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.4 
 
 
262 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.305352  normal  0.309603 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  31.47 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  34.68 
 
 
261 aa  139  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 
261 aa  139  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.02 
 
 
256 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  37.2 
 
 
266 aa  137  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  33.7 
 
 
296 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
262 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574629 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  36.54 
 
 
263 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
262 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.43 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.61 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
266 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.66 
 
 
267 aa  136  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.61 
 
 
260 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  35.43 
 
 
260 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  33.06 
 
 
267 aa  136  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  30.92 
 
 
259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3600  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.93 
 
 
263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.23 
 
 
261 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 
260 aa  135  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  32.35 
 
 
269 aa  135  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 
277 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  34.68 
 
 
251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.59 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  36.15 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>