More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0344 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0344  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 256 aa  524  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.458261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  42.13 
 
 		 259 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.96 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6880  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.84 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.98 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  38.55 
 
 		 269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  36.65 
 
 		 263 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  35.86 
 
 		 263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.43 
 
 		 267 aa  162  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  39.27 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 		 262 aa  160  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  36.65 
 
 		 263 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  35.86 
 
 		 263 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.56 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6848  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.07 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  38 
 
 		 260 aa  160  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.3 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  32.4 
 
 		 263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  36.92 
 
 		 268 aa  155  7e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  37.25 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.22 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6847  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.08 
 
 		 268 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5145  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.11 
 
 		 260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.149843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2188  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.36 
 
 		 255 aa  151  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.000498969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 		 259 aa  151  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 		 266 aa  152  8e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.34 
 
 		 264 aa  151  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  38.1 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  34.23 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  36.99 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.8 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  36.78 
 
 		 280 aa  149  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.7 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 		 267 aa  149  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.25 
 
 		 267 aa  149  6e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  39.02 
 
 		 264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.11 
 
 		 273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.92 
 
 		 264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.25 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.18 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.02 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.538415 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0194  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.08 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1457  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.7 
 
 		 287 aa  146  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.221294  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  34 
 
 		 261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  35.94 
 
 		 263 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 		 257 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 		 267 aa  145  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  34.5 
 
 		 265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2517  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.3 
 
 		 259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 		 256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 		 258 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  34.15 
 
 		 262 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 		 264 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2444  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.04 
 
 		 268 aa  144  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3726  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 		 258 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452007  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.43 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1813  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.43 
 
 		 272 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  38 
 
 		 261 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1766  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.43 
 
 		 272 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1747  enoyl-CoA hydratase  32.56 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1300  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  35.94 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132411  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6846  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.18 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  38.13 
 
 		 266 aa  142  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2583  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.05 
 
 		 269 aa  142  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.601041  normal  0.0270036 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.6 
 
 		 264 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  35.5 
 
 		 263 aa  142  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.46 
 
 		 270 aa  142  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  34.11 
 
 		 263 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  34.11 
 
 		 263 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  34.11 
 
 		 263 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  34.11 
 
 		 263 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  34.11 
 
 		 263 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  34.11 
 
 		 263 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  34.11 
 
 		 263 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 		 266 aa  142  8e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  34.1 
 
 		 264 aa  141  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  34.1 
 
 		 266 aa  141  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 		 265 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.85 
 
 		 256 aa  141  9e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 		 259 aa  141  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 266 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4071  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4359  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.56 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  34.52 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4597  enoyl-CoA hydratase  36.61 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.19 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1594  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1007  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0394132  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.43 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>