More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7538 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 264 aa  534  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  81.4 
 
 		 261 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  80.23 
 
 		 262 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0555  enoyl-CoA hydratase  80.23 
 
 		 262 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.323488  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  43.24 
 
 		 262 aa  193  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 		 264 aa  189  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.38 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.06 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  42.45 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 		 260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 		 265 aa  176  5e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.93 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  41.53 
 
 		 261 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.04 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  41.76 
 
 		 261 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.4 
 
 		 255 aa  169  6e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.31 
 
 		 259 aa  168  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.78 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.02 
 
 		 264 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  39.62 
 
 		 263 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19430  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  41 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0126218 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.47 
 
 		 274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.23 
 
 		 273 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2068  enoyl-CoA hydratase  46.67 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.847679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.64 
 
 		 264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.97 
 
 		 287 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.16 
 
 		 255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.78 
 
 		 659 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2517  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.11 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  35.61 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  39.15 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.74 
 
 		 264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0852  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.92 
 
 		 265 aa  163  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.938482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  39.15 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.78 
 
 		 268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  37.79 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  41.37 
 
 		 261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 		 264 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3834  enoyl-CoA hydratase  36.64 
 
 		 262 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.31 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.88 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.36 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  40.84 
 
 		 263 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.69 
 
 		 271 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6848  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.54 
 
 		 271 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.15 
 
 		 273 aa  159  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 		 262 aa  159  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  38.76 
 
 		 262 aa  158  8e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  38.76 
 
 		 262 aa  158  8e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0194  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.92 
 
 		 265 aa  158  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  38.85 
 
 		 263 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  38.85 
 
 		 263 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  38.85 
 
 		 263 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  38.85 
 
 		 263 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  38.85 
 
 		 263 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5145  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.11 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.149843 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  38.85 
 
 		 263 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  38.85 
 
 		 263 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.94 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  36.68 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.88 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1205  enoyl-CoA hydratase  41.13 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.755368  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2583  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.34 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.601041  normal  0.0270036 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0501  enoyl-CoA hydratase  41.2 
 
 		 263 aa  156  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.96 
 
 		 263 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0903  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 		 270 aa  155  7e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.048792  normal  0.959739 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 		 263 aa  155  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.58 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  38.78 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3447  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.23 
 
 		 261 aa  153  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  35.5 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1007  enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0394132  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.03 
 
 		 259 aa  152  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.4 
 
 		 258 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2540  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.45 
 
 		 263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.893236  normal  0.33655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 		 261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  35.23 
 
 		 263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.6 
 
 		 260 aa  151  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  36.29 
 
 		 263 aa  151  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  35.11 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.64 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.4 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  41.96 
 
 		 263 aa  150  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.86 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0330  enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150618  hitchhiker  0.00796667 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  34.73 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 		 261 aa  150  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  39.08 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.64 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.16 
 
 		 260 aa  149  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>