More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2068 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2068  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
259 aa  485  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.847679  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  49.4 
 
 
263 aa  198  7.999999999999999e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  46.67 
 
 
264 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  43.6 
 
 
261 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.69 
 
 
257 aa  176  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  42.63 
 
 
262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  42.02 
 
 
260 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.91 
 
 
260 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  44.84 
 
 
261 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.53 
 
 
264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.75 
 
 
264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8421  enoyl-CoA hydratase  46.77 
 
 
261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  43.25 
 
 
263 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0555  enoyl-CoA hydratase  42.8 
 
 
262 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.323488  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  41.63 
 
 
263 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.36 
 
 
264 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 
262 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  42.46 
 
 
263 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  46.22 
 
 
263 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.14 
 
 
273 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  42.46 
 
 
263 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.49 
 
 
255 aa  154  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1205  enoyl-CoA hydratase  44.57 
 
 
264 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.755368  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  41.54 
 
 
266 aa  153  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.23 
 
 
261 aa  153  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 
270 aa  152  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 
259 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.02 
 
 
260 aa  152  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  39.92 
 
 
263 aa  152  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  42.06 
 
 
263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  39.15 
 
 
263 aa  151  8.999999999999999e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06370  Enoyl-CoA hydratase  43.46 
 
 
283 aa  151  8.999999999999999e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.622554  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.75 
 
 
264 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 
264 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  40.62 
 
 
260 aa  150  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0852  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.34 
 
 
265 aa  149  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.938482  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0501  enoyl-CoA hydratase  47.1 
 
 
263 aa  149  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19430  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  42.52 
 
 
271 aa  149  6e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0126218 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.72 
 
 
273 aa  148  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.25 
 
 
265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  42.75 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3834  enoyl-CoA hydratase  38.74 
 
 
262 aa  146  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.43 
 
 
263 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  38.93 
 
 
270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.04 
 
 
263 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  43.6 
 
 
263 aa  145  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.31 
 
 
267 aa  145  6e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42 
 
 
258 aa  144  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  42.47 
 
 
266 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 
263 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 
263 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 
263 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 
263 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 
263 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 
263 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 
263 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.06 
 
 
270 aa  143  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3447  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.43 
 
 
261 aa  143  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  41.96 
 
 
263 aa  142  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 
257 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11165  enoyl-CoA hydratase  38.13 
 
 
268 aa  142  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.192459 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  38.25 
 
 
262 aa  142  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
264 aa  142  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4044  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 
267 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3726  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42 
 
 
258 aa  141  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452007  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
277 aa  141  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.73 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  33.08 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  39.31 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  44.19 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1238  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.15 
 
 
267 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2150  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.25 
 
 
274 aa  139  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00228605  normal  0.0108638 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.7 
 
 
255 aa  138  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0330  enoyl-CoA hydratase  38.15 
 
 
260 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150618  hitchhiker  0.00796667 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2517  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.3 
 
 
259 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  35.46 
 
 
262 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2372  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.16 
 
 
290 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00516706  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  44.06 
 
 
263 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4145  enoyl-CoA hydratase  39.6 
 
 
272 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  38.91 
 
 
266 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4299  enoyl-CoA hydratase  39.6 
 
 
272 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621755  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4070  enoyl-CoA hydratase  39.6 
 
 
272 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
263 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41 
 
 
270 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.83 
 
 
258 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  33.2 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0984  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  44.75 
 
 
266 aa  136  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  37.01 
 
 
265 aa  136  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.02 
 
 
266 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  39.45 
 
 
264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 
270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  37.21 
 
 
264 aa  135  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
262 aa  135  8e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.7 
 
 
269 aa  135  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  38.52 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  37.88 
 
 
268 aa  133  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  39.06 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>