More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0852 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0852  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
265 aa  531  1e-150  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.938482  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  44.63 
 
 
262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  44.63 
 
 
261 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  46.25 
 
 
263 aa  184  9e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  42.92 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0555  enoyl-CoA hydratase  43.39 
 
 
262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.323488  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  41.06 
 
 
260 aa  155  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  39.13 
 
 
263 aa  155  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.22 
 
 
277 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.67 
 
 
257 aa  151  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.3 
 
 
267 aa  148  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.57 
 
 
260 aa  146  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2068  enoyl-CoA hydratase  45.34 
 
 
259 aa  142  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.847679  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  36.25 
 
 
264 aa  141  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4597  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.26 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  36.13 
 
 
263 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  35.42 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  36.91 
 
 
263 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  39.5 
 
 
261 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 
266 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  38.6 
 
 
260 aa  135  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  37.39 
 
 
262 aa  135  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.9 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  35 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  40.47 
 
 
263 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  39.57 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5520  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181326 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  38.39 
 
 
275 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  36.97 
 
 
262 aa  133  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  39.5 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0568  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.91 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  37.44 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.16 
 
 
267 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  34.93 
 
 
259 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  37.82 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  36.55 
 
 
262 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  36.55 
 
 
262 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.74 
 
 
266 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  38.89 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  37.3 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  37.77 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  37.77 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  37.77 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  37.77 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1625  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.93 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0454555 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  37.77 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  37.77 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  37.77 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  33.05 
 
 
266 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1007  enoyl-CoA hydratase  36.28 
 
 
268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0394132  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 
264 aa  125  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  35.06 
 
 
284 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3671  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.69 
 
 
270 aa  125  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.222847  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  37.18 
 
 
263 aa  125  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
263 aa  125  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.41 
 
 
269 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.73 
 
 
263 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  36.15 
 
 
262 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.57 
 
 
269 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2372  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.19 
 
 
290 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00516706  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.84 
 
 
258 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.44 
 
 
268 aa  123  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.85 
 
 
264 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  37.66 
 
 
264 aa  123  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
258 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3726  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.08 
 
 
258 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452007  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.59 
 
 
270 aa  122  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  31.18 
 
 
262 aa  122  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  37.66 
 
 
266 aa  122  8e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2692  enoyl-CoA hydratase  38.81 
 
 
270 aa  122  8e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
267 aa  122  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
276 aa  122  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1836  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.395714  normal  0.321075 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.44 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.87 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  31.94 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.61 
 
 
259 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.08 
 
 
268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3841  enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 
270 aa  119  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.203847 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.85 
 
 
262 aa  119  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.8 
 
 
271 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.15 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2156  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
318 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.77 
 
 
267 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2815  enoyl-CoA hydratase  32.62 
 
 
281 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  hitchhiker  0.00311628 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.67 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0330  enoyl-CoA hydratase  31.71 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150618  hitchhiker  0.00796667 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.1 
 
 
267 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04140  1,4-Dihydroxy-2-naphthoate synthase  33.48 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  normal  0.842204 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5040  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2616  enoyl-CoA hydratase  33.62 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.807591  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  35.87 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.29 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3600  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.11 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.11 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.78 
 
 
266 aa  116  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0332  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.89 
 
 
278 aa  116  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>