More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4597 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4597  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 266 aa  537  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  40.87 
 
 		 263 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  36.73 
 
 		 261 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1625  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.99 
 
 		 259 aa  122  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454555 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.27 
 
 		 260 aa  122  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.54 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0852  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.48 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.938482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  35.75 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0897  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.82 
 
 		 265 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  34.04 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.39 
 
 		 255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.05 
 
 		 258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.24 
 
 		 257 aa  119  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 256 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.19 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.12 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2880  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.62 
 
 		 280 aa  116  5e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1147  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.07 
 
 		 275 aa  115  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  32.1 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0555  enoyl-CoA hydratase  36.91 
 
 		 262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.323488  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  30.45 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0344  enoyl-CoA hydratase  31.25 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.458261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.98 
 
 		 273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  34.21 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.39 
 
 		 270 aa  112  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  31.62 
 
 		 270 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.03 
 
 		 661 aa  112  6e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.6 
 
 		 662 aa  112  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32 
 
 		 264 aa  112  7.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.12 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.75 
 
 		 662 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4817  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.09 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0238476 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  32.43 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.71 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0298  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1205  enoyl-CoA hydratase  39.08 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.755368  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.75 
 
 		 662 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  35.84 
 
 		 258 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1007  enoyl-CoA hydratase  38.62 
 
 		 268 aa  109  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0394132  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.05 
 
 		 255 aa  108  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.44 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  31.58 
 
 		 265 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.26 
 
 		 264 aa  108  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.27 
 
 		 267 aa  108  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  30.21 
 
 		 262 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.7 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4553  enoyl-CoA hydratase  34.44 
 
 		 261 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0511055  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4708  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  35.98 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.740902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2444  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.89 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.65 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.63 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6848  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.71 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1254  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.497005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1271  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.84 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.97 
 
 		 260 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  31.8 
 
 		 262 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3834  enoyl-CoA hydratase  32.59 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  32.06 
 
 		 267 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3671  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.38 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.222847  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1621  enoyl-CoA hydratase  33.5 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  32.3 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.63 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  33.49 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.61 
 
 		 267 aa  106  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.89 
 
 		 268 aa  105  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.76 
 
 		 266 aa  105  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  32.41 
 
 		 265 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2378  enoyl-CoA hydratase  34.42 
 
 		 257 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3841  enoyl-CoA hydratase  32.13 
 
 		 270 aa  105  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.203847 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.53 
 
 		 263 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.12 
 
 		 259 aa  105  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.82 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.84 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1281  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0436813  normal  0.258373 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.68 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0067  enoyl-CoA hydratase  35.44 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  32.03 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2998  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.42 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.172994  normal  0.145485 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  33.62 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  29.44 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  33.91 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.19 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1048  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.72 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6846  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.35 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  32.54 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5354  enoyl-CoA hydratase  31.17 
 
 		 260 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5507  enoyl-CoA hydratase  31.17 
 
 		 260 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  28.5 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.08 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.97 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>