More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2998 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2998  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
206 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.172994  normal  0.145485 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0913  enoyl-CoA hydratase  82.27 
 
 
206 aa  291  7e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2572  enoyl-CoA hydratase/isomerase  81.77 
 
 
206 aa  289  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.95 
 
 
204 aa  236  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0406  enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.44 
 
 
203 aa  234  5.0000000000000005e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00846941  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  68.29 
 
 
206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.419854  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0067  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.12 
 
 
248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000315563 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.93 
 
 
258 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3742  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.43 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.262023  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.39 
 
 
264 aa  109  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3883  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.43 
 
 
262 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0303551  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.07 
 
 
257 aa  109  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.87 
 
 
263 aa  109  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.81 
 
 
259 aa  108  5e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3860  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.81 
 
 
261 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.897739 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  39.62 
 
 
263 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  39.62 
 
 
263 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  39.62 
 
 
263 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  39.62 
 
 
263 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  39.62 
 
 
263 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  39.62 
 
 
263 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  39.62 
 
 
263 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3799  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.43 
 
 
262 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0645207  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  36.67 
 
 
256 aa  106  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.22 
 
 
260 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  41.88 
 
 
257 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.26 
 
 
261 aa  106  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.86 
 
 
254 aa  106  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  40.98 
 
 
278 aa  105  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.29 
 
 
262 aa  105  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.1 
 
 
260 aa  105  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.54 
 
 
267 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.83 
 
 
659 aa  103  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4597  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.42 
 
 
266 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.14 
 
 
260 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.21 
 
 
258 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  35.57 
 
 
260 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.37 
 
 
252 aa  103  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  38.21 
 
 
263 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.58 
 
 
257 aa  102  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  35.07 
 
 
267 aa  102  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.65 
 
 
257 aa  102  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  38.38 
 
 
258 aa  102  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.98 
 
 
260 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  38.83 
 
 
262 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  35.5 
 
 
261 aa  101  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.12 
 
 
269 aa  101  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.16 
 
 
257 aa  101  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.5 
 
 
254 aa  101  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.85 
 
 
264 aa  100  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.5 
 
 
257 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.49 
 
 
257 aa  101  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1755  enoyl-CoA hydratase  37.77 
 
 
244 aa  100  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.5 
 
 
266 aa  99.8  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.07 
 
 
260 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.68 
 
 
260 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4812  enoyl-CoA hydratase  37.04 
 
 
244 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.365377  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  35.96 
 
 
263 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4431  enoyl-CoA hydratase  37.04 
 
 
244 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4518  enoyl-CoA hydratase  37.04 
 
 
244 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.08 
 
 
260 aa  99.8  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4819  enoyl-CoA hydratase  36.14 
 
 
263 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 
261 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  38.1 
 
 
260 aa  99.4  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.76 
 
 
263 aa  99  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.23 
 
 
262 aa  99  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0897  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.99 
 
 
265 aa  99  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.05 
 
 
262 aa  99  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  39.69 
 
 
280 aa  99  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.3 
 
 
261 aa  99  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1846  enoyl-CoA hydratase  33.8 
 
 
263 aa  99  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10923  enoyl-CoA hydratase  35.11 
 
 
243 aa  98.2  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269045  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.41 
 
 
260 aa  97.8  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.22 
 
 
259 aa  97.8  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1813  short chain enoyl-CoA hydratase  39.27 
 
 
288 aa  97.8  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.52 
 
 
661 aa  97.4  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3592  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.68 
 
 
262 aa  97.8  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.205744 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
267 aa  97.1  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  37.43 
 
 
262 aa  96.3  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.02 
 
 
261 aa  96.7  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1417  enoyl-CoA hydratase  33.18 
 
 
258 aa  97.1  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  36.04 
 
 
263 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.1 
 
 
257 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.16 
 
 
258 aa  96.3  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4992  enoyl-CoA hydratase  37.23 
 
 
246 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388804  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
257 aa  96.3  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.18 
 
 
259 aa  95.9  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.64 
 
 
258 aa  95.5  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.75 
 
 
267 aa  95.5  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  32.29 
 
 
257 aa  95.5  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.11 
 
 
258 aa  95.5  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.16 
 
 
662 aa  95.1  6e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.5 
 
 
254 aa  94.7  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.02 
 
 
260 aa  94.7  8e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04036  hypothetical protein  36.72 
 
 
260 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.13651  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.58 
 
 
257 aa  94.7  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5442  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  37.7 
 
 
692 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.68 
 
 
265 aa  94  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  37.64 
 
 
256 aa  94  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>