More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1217 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
254 aa  506  9.999999999999999e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  83.4 
 
 
257 aa  432  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.45 
 
 
260 aa  221  7e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.79 
 
 
262 aa  211  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1666  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.38 
 
 
259 aa  196  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.458425  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2546  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.69 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2974  methylglutaconyl-CoA hydratase  38.87 
 
 
258 aa  182  7e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.240508 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.75 
 
 
261 aa  169  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  41.3 
 
 
275 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  42.04 
 
 
266 aa  166  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 
269 aa  164  9e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
259 aa  163  3e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  40.64 
 
 
273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 
275 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
264 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  39.59 
 
 
261 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.31 
 
 
260 aa  156  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
264 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.2 
 
 
254 aa  155  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 
265 aa  155  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  39.15 
 
 
661 aa  154  9e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
265 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
275 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.65 
 
 
266 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.86 
 
 
258 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  36.89 
 
 
264 aa  154  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  34.13 
 
 
268 aa  154  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.93 
 
 
273 aa  154  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1228  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.9 
 
 
255 aa  153  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115754  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 
275 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  37.9 
 
 
275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  40.78 
 
 
270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42 
 
 
263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.74 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.96 
 
 
266 aa  152  5e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  36.54 
 
 
662 aa  152  5e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 
265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.2 
 
 
258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 
260 aa  152  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.4 
 
 
267 aa  152  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  31.75 
 
 
264 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.05 
 
 
265 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1889  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.08 
 
 
261 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.47 
 
 
260 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1196  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.17 
 
 
261 aa  150  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  39.27 
 
 
261 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  38.87 
 
 
261 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.2 
 
 
261 aa  149  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.08 
 
 
260 aa  149  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5876  enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 
268 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000379  methylglutaconyl-CoA hydratase  31.78 
 
 
260 aa  148  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 
266 aa  148  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.25 
 
 
260 aa  148  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  31.6 
 
 
268 aa  148  9e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  33.88 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6359  enoyl-CoA hydratase  37.08 
 
 
267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0245012  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.43 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
257 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2177  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.82 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 
266 aa  146  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.69 
 
 
269 aa  146  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  34.23 
 
 
269 aa  146  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.44 
 
 
262 aa  146  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.80898  normal  0.0526792 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.46 
 
 
258 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.38 
 
 
662 aa  145  5e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  37.01 
 
 
257 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.24 
 
 
262 aa  145  6e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.346332 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.06 
 
 
258 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0016  enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 
264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
266 aa  145  7.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0013  enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 
264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.76945  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.86 
 
 
259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
264 aa  145  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.72 
 
 
255 aa  145  9e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 
257 aa  144  9e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3560  enoyl-CoA hydratase  33.74 
 
 
261 aa  145  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  0.681353 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  36.22 
 
 
259 aa  145  9e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.72 
 
 
255 aa  145  9e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0804  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
261 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0469  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
261 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 
257 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0652  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
261 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.572722  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1606  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
261 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2054  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
261 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577425  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.04 
 
 
264 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0540  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
261 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1957  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
261 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4688  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
261 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.484689  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 
257 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.18 
 
 
262 aa  143  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0949  enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 
261 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362092  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  32.1 
 
 
258 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  32.92 
 
 
259 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>