More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2669 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 275 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  93.8 
 
 		 275 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  88.36 
 
 		 275 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  75.27 
 
 		 275 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  73.7 
 
 		 273 aa  401  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.76 
 
 		 273 aa  326  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4341  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.73 
 
 		 276 aa  321  7e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.538809  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  60.77 
 
 		 266 aa  310  2e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59 
 
 		 263 aa  293  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  60.54 
 
 		 261 aa  290  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  57.98 
 
 		 274 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.3 
 
 		 260 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0864  enoyl-CoA hydratase  58.69 
 
 		 273 aa  281  9e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281406  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.2 
 
 		 275 aa  278  5e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.42 
 
 		 260 aa  278  9e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.2 
 
 		 266 aa  275  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  55.6 
 
 		 270 aa  275  7e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4900  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.38 
 
 		 266 aa  274  9e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.38 
 
 		 270 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.403885 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1325  enoyl-CoA hydratase  54.09 
 
 		 277 aa  268  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  53.08 
 
 		 261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  52.11 
 
 		 262 aa  266  2.9999999999999995e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  51.92 
 
 		 264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4950  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.91 
 
 		 265 aa  264  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  52.69 
 
 		 261 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.47 
 
 		 265 aa  259  4e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  52.36 
 
 		 264 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2559  enoyl-CoA hydratase  59.32 
 
 		 261 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  51.92 
 
 		 261 aa  255  6e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  50.57 
 
 		 262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.88 
 
 		 269 aa  249  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.88 
 
 		 274 aa  249  3e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  51.29 
 
 		 266 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.76 
 
 		 269 aa  249  5e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1221  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.38 
 
 		 273 aa  248  8e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212556  normal  0.0915283 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  49.63 
 
 		 269 aa  246  4e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.08 
 
 		 262 aa  245  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.09 
 
 		 269 aa  239  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.98 
 
 		 269 aa  239  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  51.5 
 
 		 264 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  52.29 
 
 		 264 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  50.37 
 
 		 264 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  51.13 
 
 		 290 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  51.13 
 
 		 290 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  52.08 
 
 		 278 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 		 270 aa  237  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  51.12 
 
 		 264 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  50.91 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1436  enoyl-CoA hydratase  48.31 
 
 		 269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.518043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  51.71 
 
 		 261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  52.09 
 
 		 261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.42 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0993  enoyl-CoA hydratase  52.19 
 
 		 269 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  52.09 
 
 		 261 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  49.45 
 
 		 272 aa  232  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  52.24 
 
 		 264 aa  232  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  49.62 
 
 		 272 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  49.62 
 
 		 272 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  51 
 
 		 269 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.72 
 
 		 272 aa  228  9e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0757  enoyl-CoA hydratase  49.81 
 
 		 269 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457291  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1947  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  41.51 
 
 		 270 aa  223  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2717  enoyl-CoA hydratase  48.09 
 
 		 265 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2388  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.28 
 
 		 269 aa  221  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.07 
 
 		 261 aa  218  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2554  enoyl-CoA hydratase  47.53 
 
 		 267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  47.1 
 
 		 257 aa  209  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.14 
 
 		 263 aa  203  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4125  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.06 
 
 		 257 aa  192  7e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6127  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.66 
 
 		 255 aa  189  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29450  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  44.76 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  36.54 
 
 		 258 aa  158  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 		 259 aa  156  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.54 
 
 		 258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.21 
 
 		 258 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 		 254 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.61 
 
 		 258 aa  145  8.000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.78 
 
 		 266 aa  143  4e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.57 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2177  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 		 255 aa  142  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.23 
 
 		 260 aa  142  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.95 
 
 		 260 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 		 257 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 		 257 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 		 257 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.2 
 
 		 256 aa  142  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  38.28 
 
 		 261 aa  142  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  36.7 
 
 		 257 aa  141  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4360  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.97 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.884728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6471  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.3 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.1 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 		 259 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>