More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0608 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 263 aa  531  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29450  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  59.68 
 
 		 257 aa  316  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4125  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.23 
 
 		 257 aa  299  3e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6127  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.13 
 
 		 255 aa  296  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  50.58 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.65 
 
 		 269 aa  233  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.33 
 
 		 274 aa  225  6e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  50 
 
 		 262 aa  223  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  50.62 
 
 		 261 aa  222  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  50.62 
 
 		 261 aa  222  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  50.62 
 
 		 261 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.24 
 
 		 273 aa  221  8e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  48 
 
 		 269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2717  enoyl-CoA hydratase  49.79 
 
 		 265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  51.05 
 
 		 278 aa  219  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.59 
 
 		 269 aa  219  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  49.8 
 
 		 272 aa  218  7e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  49.8 
 
 		 272 aa  218  7e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  50.42 
 
 		 264 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  50.83 
 
 		 264 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  50.21 
 
 		 290 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  50.21 
 
 		 290 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  50.21 
 
 		 264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  48.62 
 
 		 266 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.6 
 
 		 265 aa  215  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  49.38 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  48.56 
 
 		 264 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.36 
 
 		 263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  49.59 
 
 		 261 aa  211  7e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.42 
 
 		 269 aa  210  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  45.34 
 
 		 273 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  47.81 
 
 		 270 aa  209  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  45.7 
 
 		 275 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0757  enoyl-CoA hydratase  48.36 
 
 		 269 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  47.54 
 
 		 269 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.97 
 
 		 269 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0993  enoyl-CoA hydratase  47.13 
 
 		 269 aa  205  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  45.14 
 
 		 275 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  44.27 
 
 		 275 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  44.14 
 
 		 275 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  50.62 
 
 		 280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  48.56 
 
 		 272 aa  199  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.15 
 
 		 272 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  48.31 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.08 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  44.18 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.68 
 
 		 260 aa  192  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  43.37 
 
 		 274 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1436  enoyl-CoA hydratase  47.33 
 
 		 269 aa  192  5e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.518043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4341  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.02 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.538809  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2554  enoyl-CoA hydratase  48.54 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  42.31 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2559  enoyl-CoA hydratase  47.66 
 
 		 261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  43.02 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  44.4 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.61 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4950  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.49 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  40.46 
 
 		 264 aa  186  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.62 
 
 		 275 aa  186  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1325  enoyl-CoA hydratase  41.77 
 
 		 277 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1221  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.68 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212556  normal  0.0915283 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  42.64 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1947  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  36.78 
 
 		 270 aa  182  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.94 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.403885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.67 
 
 		 260 aa  182  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.41 
 
 		 266 aa  182  7e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4900  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.53 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2388  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.25 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.54 
 
 		 261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0864  enoyl-CoA hydratase  42.25 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281406  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.18 
 
 		 258 aa  162  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  36.82 
 
 		 258 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.96 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  31.25 
 
 		 259 aa  132  6.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 		 258 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.05 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6359  enoyl-CoA hydratase  34.14 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0245012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.04 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0652  enoyl-CoA hydratase  34.18 
 
 		 261 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.572722  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0804  enoyl-CoA hydratase  34.18 
 
 		 261 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2054  enoyl-CoA hydratase  34.18 
 
 		 261 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577425  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0469  enoyl-CoA hydratase  34.18 
 
 		 261 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0540  enoyl-CoA hydratase  34.18 
 
 		 261 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1957  enoyl-CoA hydratase  34.18 
 
 		 261 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1606  enoyl-CoA hydratase  34.18 
 
 		 261 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6471  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.2 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  37.15 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.76 
 
 		 262 aa  123  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 		 261 aa  122  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  34.48 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.1 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  34.1 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.06 
 
 		 257 aa  119  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  29.57 
 
 		 257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.89 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2144  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 		 253 aa  119  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  31.37 
 
 		 263 aa  118  7.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.56 
 
 		 662 aa  118  7.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>