More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1499 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 270 aa  545  1e-154  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  54.84 
 
 		 264 aa  263  3e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  53.66 
 
 		 273 aa  252  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.77 
 
 		 263 aa  249  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.44 
 
 		 273 aa  248  5e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  55.19 
 
 		 270 aa  248  5e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  55.23 
 
 		 264 aa  248  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.42 
 
 		 265 aa  246  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  54.36 
 
 		 278 aa  246  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  54.77 
 
 		 264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.17 
 
 		 269 aa  245  6e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  54.77 
 
 		 264 aa  245  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  55.42 
 
 		 261 aa  244  8e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  54.77 
 
 		 290 aa  244  9e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  54.77 
 
 		 290 aa  244  9e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  51.61 
 
 		 275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  54.36 
 
 		 264 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  52.03 
 
 		 275 aa  242  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  51.16 
 
 		 266 aa  242  6e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  53.5 
 
 		 280 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.91 
 
 		 269 aa  241  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  50.99 
 
 		 261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  50.99 
 
 		 261 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0757  enoyl-CoA hydratase  49.63 
 
 		 269 aa  238  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  52.28 
 
 		 264 aa  238  8e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  50.59 
 
 		 261 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  50 
 
 		 275 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  48.21 
 
 		 262 aa  236  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2717  enoyl-CoA hydratase  49.81 
 
 		 265 aa  236  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1221  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.63 
 
 		 273 aa  236  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212556  normal  0.0915283 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  50 
 
 		 275 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.97 
 
 		 274 aa  236  3e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 		 263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.48 
 
 		 260 aa  233  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1436  enoyl-CoA hydratase  51.92 
 
 		 269 aa  233  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.518043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  51.45 
 
 		 272 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  51.45 
 
 		 272 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.19 
 
 		 275 aa  231  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  47.89 
 
 		 266 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.41 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.53 
 
 		 260 aa  229  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  48.31 
 
 		 269 aa  229  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  46.15 
 
 		 264 aa  229  4e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0993  enoyl-CoA hydratase  50.82 
 
 		 269 aa  229  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2388  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.24 
 
 		 269 aa  228  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  48.22 
 
 		 261 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  51.04 
 
 		 269 aa  227  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  46.25 
 
 		 262 aa  226  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.86 
 
 		 269 aa  225  5.0000000000000005e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  47.43 
 
 		 261 aa  225  6e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  47.43 
 
 		 261 aa  224  8e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.58 
 
 		 266 aa  224  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4341  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.58 
 
 		 276 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.538809  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2554  enoyl-CoA hydratase  50.6 
 
 		 267 aa  221  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.28 
 
 		 260 aa  219  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.1 
 
 		 272 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0864  enoyl-CoA hydratase  49.8 
 
 		 273 aa  219  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281406  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  47.1 
 
 		 272 aa  218  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  45.25 
 
 		 274 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.02 
 
 		 262 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.81 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4900  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.39 
 
 		 266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.53 
 
 		 270 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.403885 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  48.63 
 
 		 257 aa  211  9e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1947  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  42.08 
 
 		 270 aa  206  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29450  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  46 
 
 		 257 aa  205  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4950  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.26 
 
 		 265 aa  202  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4125  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46 
 
 		 257 aa  201  7e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1325  enoyl-CoA hydratase  43.18 
 
 		 277 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2559  enoyl-CoA hydratase  51.04 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6127  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.8 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.98 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  39.06 
 
 		 258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.06 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.89 
 
 		 258 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  40.38 
 
 		 263 aa  159  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  38.04 
 
 		 260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6359  enoyl-CoA hydratase  37.19 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0245012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3042  enoyl-CoA hydratase  39.11 
 
 		 260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.421055  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 		 255 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 		 255 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 		 255 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4387  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.92 
 
 		 275 aa  145  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0213556  normal  0.916822 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.55 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  37.3 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  35.51 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  37.7 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  36.72 
 
 		 260 aa  142  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4721  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 		 262 aa  142  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  36.21 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3560  enoyl-CoA hydratase  35.92 
 
 		 261 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  0.681353 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2177  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2144  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.49 
 
 		 253 aa  139  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1889  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.89 
 
 		 261 aa  138  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6471  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.22 
 
 		 264 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0540  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1606  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>