More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4436 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 270 aa  535  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.403885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4900  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  97.37 
 
 		 266 aa  480  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4950  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  86.38 
 
 		 265 aa  383  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  80.86 
 
 		 260 aa  377  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  80.08 
 
 		 260 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  59.92 
 
 		 275 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  61.18 
 
 		 273 aa  291  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  59.38 
 
 		 275 aa  291  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.91 
 
 		 273 aa  287  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  59.22 
 
 		 275 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  59.14 
 
 		 275 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4341  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.18 
 
 		 276 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.538809  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.06 
 
 		 263 aa  275  7e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  58.89 
 
 		 270 aa  270  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  57.09 
 
 		 261 aa  268  5e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  56.69 
 
 		 261 aa  265  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.69 
 
 		 275 aa  265  5e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  55.77 
 
 		 264 aa  264  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  53.91 
 
 		 274 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  55.34 
 
 		 261 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  56.15 
 
 		 278 aa  260  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  55.81 
 
 		 266 aa  260  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  56.87 
 
 		 261 aa  259  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  58.33 
 
 		 261 aa  255  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  58.33 
 
 		 261 aa  255  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  52.94 
 
 		 262 aa  254  9e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  54.69 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  58.33 
 
 		 261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  52.33 
 
 		 262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.87 
 
 		 266 aa  252  4.0000000000000004e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  54.69 
 
 		 264 aa  252  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  54.3 
 
 		 264 aa  251  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  53.28 
 
 		 264 aa  251  7e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  54.62 
 
 		 266 aa  251  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  54.69 
 
 		 290 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  54.69 
 
 		 290 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  55.81 
 
 		 264 aa  247  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  54.94 
 
 		 272 aa  245  4e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  54.94 
 
 		 272 aa  245  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  52.55 
 
 		 269 aa  245  6e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.63 
 
 		 274 aa  244  6.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1325  enoyl-CoA hydratase  50.79 
 
 		 277 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  52.8 
 
 		 264 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.64 
 
 		 265 aa  242  5e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.09 
 
 		 262 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2559  enoyl-CoA hydratase  56.64 
 
 		 261 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.78 
 
 		 269 aa  239  5e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1436  enoyl-CoA hydratase  53.31 
 
 		 269 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.518043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  53.88 
 
 		 269 aa  235  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0993  enoyl-CoA hydratase  54.69 
 
 		 269 aa  235  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0757  enoyl-CoA hydratase  54.03 
 
 		 269 aa  234  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.16 
 
 		 269 aa  232  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.39 
 
 		 269 aa  230  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2717  enoyl-CoA hydratase  50.59 
 
 		 265 aa  229  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.36 
 
 		 260 aa  228  9e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0864  enoyl-CoA hydratase  53.57 
 
 		 273 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281406  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2554  enoyl-CoA hydratase  55.6 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49 
 
 		 270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1947  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  41.47 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1221  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.27 
 
 		 273 aa  209  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212556  normal  0.0915283 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.33 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.88 
 
 		 272 aa  207  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  50.39 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  49.61 
 
 		 257 aa  206  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  47.88 
 
 		 272 aa  206  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.94 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2388  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.45 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.94 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29450  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  43.46 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6127  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.9 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4125  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.65 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.28 
 
 		 258 aa  158  8e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 		 264 aa  139  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  41.71 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  36.15 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.8 
 
 		 255 aa  132  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6299  short chain enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  40.08 
 
 		 263 aa  129  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.88 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1228  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.02 
 
 		 255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115754  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  32.83 
 
 		 268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  40.85 
 
 		 264 aa  125  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  34.84 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.52 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.73 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  32.06 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.05 
 
 		 260 aa  123  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2090  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.79 
 
 		 253 aa  123  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0323462  normal  0.4563 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1464  enoyl-CoA hydratase  36.92 
 
 		 262 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0344  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.11 
 
 		 252 aa  122  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3560  enoyl-CoA hydratase  35.83 
 
 		 261 aa  122  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  0.681353 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  38.83 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.68 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1551  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0345  enoyl-CoA hydratase  35.53 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.918373  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4688  enoyl-CoA hydratase  34.77 
 
 		 261 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.484689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  30.98 
 
 		 258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 		 261 aa  119  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>