More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2752 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
261 aa  509  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1436  enoyl-CoA hydratase  65.06 
 
 
269 aa  318  5e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.518043  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.2 
 
 
260 aa  303  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.56 
 
 
269 aa  301  8.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.06 
 
 
269 aa  298  6e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  61.81 
 
 
280 aa  295  7e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1221  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.92 
 
 
273 aa  289  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212556  normal  0.0915283 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  60.71 
 
 
264 aa  288  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  60 
 
 
264 aa  288  7e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.47 
 
 
269 aa  288  7e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  60.32 
 
 
264 aa  287  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.68 
 
 
262 aa  287  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  60.32 
 
 
264 aa  287  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  60.71 
 
 
290 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  60.71 
 
 
290 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0757  enoyl-CoA hydratase  57.69 
 
 
269 aa  284  9e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457291  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  61.2 
 
 
278 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  60.89 
 
 
272 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  60.89 
 
 
272 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0993  enoyl-CoA hydratase  60.42 
 
 
269 aa  278  7e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  56.92 
 
 
266 aa  277  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  59.17 
 
 
269 aa  275  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2388  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.73 
 
 
269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2554  enoyl-CoA hydratase  61.11 
 
 
267 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  56.4 
 
 
272 aa  271  5.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  56.57 
 
 
269 aa  268  8e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.2 
 
 
272 aa  266  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  58.04 
 
 
264 aa  266  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  52.94 
 
 
262 aa  264  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2717  enoyl-CoA hydratase  55.73 
 
 
265 aa  263  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  58.96 
 
 
261 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  58.96 
 
 
261 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.8 
 
 
274 aa  260  1e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  58.57 
 
 
261 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  56.85 
 
 
270 aa  254  9e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.79 
 
 
263 aa  251  9.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.91 
 
 
273 aa  248  5e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  56.81 
 
 
261 aa  248  6e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  52.14 
 
 
264 aa  248  7e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  48.82 
 
 
262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  52.49 
 
 
275 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  56.45 
 
 
257 aa  231  8.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  51.97 
 
 
261 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  54.07 
 
 
275 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.53 
 
 
265 aa  228  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  50.2 
 
 
261 aa  228  8e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.81 
 
 
270 aa  227  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  51.33 
 
 
275 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  49.8 
 
 
261 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.91 
 
 
275 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.55 
 
 
260 aa  225  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4900  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.33 
 
 
266 aa  223  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.39 
 
 
266 aa  223  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.33 
 
 
270 aa  223  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.403885 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  48.63 
 
 
273 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  51.43 
 
 
275 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.73 
 
 
260 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  49.22 
 
 
266 aa  209  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  45.16 
 
 
264 aa  206  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2559  enoyl-CoA hydratase  54.18 
 
 
261 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4341  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.92 
 
 
276 aa  203  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.538809  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4950  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.57 
 
 
265 aa  203  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  47.24 
 
 
274 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1325  enoyl-CoA hydratase  45.67 
 
 
277 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0864  enoyl-CoA hydratase  49.61 
 
 
273 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281406  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29450  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  48.12 
 
 
257 aa  189  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.92 
 
 
263 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.64 
 
 
269 aa  186  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1947  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  38.82 
 
 
270 aa  179  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6127  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.86 
 
 
255 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4125  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.08 
 
 
257 aa  176  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.27 
 
 
258 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  37.29 
 
 
258 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2144  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.4 
 
 
253 aa  131  9e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268897  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.02 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.86 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  33.86 
 
 
256 aa  124  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6359  enoyl-CoA hydratase  35.36 
 
 
267 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0245012  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.95 
 
 
267 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3291  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.89 
 
 
263 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1173  enoyl-CoA hydratase  38.71 
 
 
262 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.2 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2511  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1150  enoyl-CoA hydratase  38.06 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.283717 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.91 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  31.15 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
259 aa  119  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1889  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 
261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  30.65 
 
 
265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  43.41 
 
 
267 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.32 
 
 
266 aa  118  7.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  38.08 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  32.23 
 
 
257 aa  116  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2927  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.66 
 
 
273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.4 
 
 
258 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.16 
 
 
258 aa  115  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  38.36 
 
 
251 aa  115  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>