More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2156 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
261 aa  520  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  66.12 
 
 
270 aa  322  6e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  61.22 
 
 
275 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.38 
 
 
263 aa  292  5e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  60.16 
 
 
264 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  60.54 
 
 
275 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  60.16 
 
 
290 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  60.16 
 
 
290 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.3 
 
 
273 aa  288  5.0000000000000004e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  58.98 
 
 
264 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  58.98 
 
 
264 aa  285  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  59.62 
 
 
275 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  59.38 
 
 
264 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  58.43 
 
 
261 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.61 
 
 
265 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  54.96 
 
 
262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  58.56 
 
 
275 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  58.04 
 
 
261 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  58.46 
 
 
278 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  58.04 
 
 
261 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  57.31 
 
 
266 aa  280  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  59.3 
 
 
273 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  57.79 
 
 
266 aa  278  5e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  57.25 
 
 
264 aa  278  7e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.74 
 
 
274 aa  275  4e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2559  enoyl-CoA hydratase  62.6 
 
 
261 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  58.47 
 
 
272 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  58.47 
 
 
272 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  56.92 
 
 
274 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4341  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.36 
 
 
276 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.538809  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.73 
 
 
269 aa  265  5e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2717  enoyl-CoA hydratase  57.2 
 
 
265 aa  262  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1436  enoyl-CoA hydratase  53.94 
 
 
269 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.518043  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  52.73 
 
 
269 aa  260  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.36 
 
 
269 aa  259  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.76 
 
 
269 aa  259  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.92 
 
 
262 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1325  enoyl-CoA hydratase  54.94 
 
 
277 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.76 
 
 
260 aa  258  6e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  52.99 
 
 
264 aa  258  6e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.09 
 
 
260 aa  258  7e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.38 
 
 
275 aa  257  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  53.82 
 
 
264 aa  255  4e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.08 
 
 
260 aa  254  7e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4900  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.48 
 
 
266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.87 
 
 
270 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.403885 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  55.81 
 
 
280 aa  251  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  51.15 
 
 
262 aa  249  4e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1221  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.39 
 
 
273 aa  248  8e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212556  normal  0.0915283 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.69 
 
 
266 aa  246  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4950  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.13 
 
 
265 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  53.23 
 
 
261 aa  244  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.42 
 
 
270 aa  244  8e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.02 
 
 
269 aa  244  9e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  53.25 
 
 
269 aa  244  9e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0993  enoyl-CoA hydratase  54.07 
 
 
269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  53.28 
 
 
272 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.87 
 
 
272 aa  240  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0757  enoyl-CoA hydratase  51.2 
 
 
269 aa  237  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457291  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0864  enoyl-CoA hydratase  55.56 
 
 
273 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281406  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  51.61 
 
 
261 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  51.61 
 
 
261 aa  235  6e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.81 
 
 
261 aa  235  6e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2554  enoyl-CoA hydratase  50.97 
 
 
267 aa  234  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1947  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  45.49 
 
 
270 aa  231  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2388  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 
269 aa  227  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
257 aa  215  7e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.59 
 
 
263 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6127  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.99 
 
 
255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4125  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.19 
 
 
257 aa  195  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29450  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  46.25 
 
 
257 aa  188  7e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
258 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2177  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.39 
 
 
255 aa  167  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6359  enoyl-CoA hydratase  38.93 
 
 
267 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0245012  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 
258 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6471  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.16 
 
 
264 aa  158  9e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
258 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  40.42 
 
 
258 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  40.61 
 
 
261 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3413  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.21 
 
 
256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 
261 aa  152  7e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  36.03 
 
 
259 aa  151  8e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 
261 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2206  enoyl-CoA hydratase  36.84 
 
 
259 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0233003  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.59 
 
 
254 aa  149  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.59 
 
 
258 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
260 aa  148  8e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0109  enoyl-CoA hydratase  38.93 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3088  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.99 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.59 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.69 
 
 
258 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  39.76 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2144  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268897  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6299  short chain enoyl-CoA hydratase  38.8 
 
 
266 aa  145  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 
260 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1746  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.51 
 
 
270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82012  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.51 
 
 
262 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36 
 
 
261 aa  145  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  34.66 
 
 
283 aa  145  9e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 
270 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.578699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>