More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3470 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
266 aa  541  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  82.21 
 
 
272 aa  428  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  82.21 
 
 
272 aa  428  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  76.81 
 
 
264 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  75.67 
 
 
264 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  76.43 
 
 
264 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  76.81 
 
 
290 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  76.81 
 
 
290 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  76.81 
 
 
278 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  75.67 
 
 
264 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  79.37 
 
 
261 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  76.05 
 
 
264 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  78.97 
 
 
261 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  78.97 
 
 
261 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2717  enoyl-CoA hydratase  72.44 
 
 
265 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.46 
 
 
269 aa  319  3e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  61 
 
 
262 aa  306  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  58.43 
 
 
262 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.87 
 
 
269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.12 
 
 
274 aa  302  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  60.63 
 
 
269 aa  301  5.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.89 
 
 
269 aa  298  4e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.22 
 
 
260 aa  295  6e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1436  enoyl-CoA hydratase  59.77 
 
 
269 aa  293  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.518043  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0757  enoyl-CoA hydratase  59.13 
 
 
269 aa  291  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457291  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.87 
 
 
272 aa  288  5.0000000000000004e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  60.63 
 
 
257 aa  288  6e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0993  enoyl-CoA hydratase  58.54 
 
 
269 aa  287  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  57.48 
 
 
272 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  57.79 
 
 
280 aa  285  4e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  56.91 
 
 
269 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1221  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.86 
 
 
273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212556  normal  0.0915283 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2388  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.41 
 
 
269 aa  281  8.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  57.31 
 
 
261 aa  280  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  56.03 
 
 
261 aa  272  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.67 
 
 
266 aa  271  9e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.6 
 
 
263 aa  270  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  55.25 
 
 
261 aa  270  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.45 
 
 
273 aa  269  4e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  54.86 
 
 
261 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2554  enoyl-CoA hydratase  58.27 
 
 
267 aa  267  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  51.74 
 
 
264 aa  266  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  54.79 
 
 
275 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  54.76 
 
 
270 aa  264  8.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.08 
 
 
275 aa  260  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  54.75 
 
 
275 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.92 
 
 
261 aa  260  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  53.08 
 
 
273 aa  256  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  53.05 
 
 
266 aa  256  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2559  enoyl-CoA hydratase  57.81 
 
 
261 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  49.81 
 
 
262 aa  256  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  52.65 
 
 
275 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4900  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  55 
 
 
266 aa  249  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  51.29 
 
 
275 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.41 
 
 
265 aa  248  9e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.62 
 
 
270 aa  247  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.403885 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.76 
 
 
260 aa  242  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4950  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.99 
 
 
265 aa  240  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  49.21 
 
 
264 aa  241  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  49.42 
 
 
274 aa  238  9e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4341  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.62 
 
 
276 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.538809  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.89 
 
 
270 aa  230  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.57 
 
 
260 aa  228  8e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.62 
 
 
263 aa  216  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1325  enoyl-CoA hydratase  45.11 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0864  enoyl-CoA hydratase  49.03 
 
 
273 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281406  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1947  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  39.62 
 
 
270 aa  201  8e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.31 
 
 
269 aa  201  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29450  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  46.83 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.77 
 
 
258 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4125  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.8 
 
 
257 aa  194  9e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6127  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.91 
 
 
255 aa  188  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6359  enoyl-CoA hydratase  34.75 
 
 
267 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0245012  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.25 
 
 
260 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.86 
 
 
260 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  38.91 
 
 
260 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2144  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.9 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268897  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3413  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
265 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  39.52 
 
 
263 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6471  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.25 
 
 
264 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2927  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 
273 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 
268 aa  136  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  34.8 
 
 
258 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 
260 aa  135  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1889  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.05 
 
 
261 aa  135  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.8 
 
 
258 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 
268 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.4 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1666  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.458425  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.8 
 
 
262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 
262 aa  133  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.99 
 
 
267 aa  133  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0109  enoyl-CoA hydratase  35.8 
 
 
259 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.4 
 
 
273 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39 
 
 
260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
261 aa  132  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.18 
 
 
262 aa  132  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.80898  normal  0.0526792 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>