More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2075 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 260 aa  523  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  75.29 
 
 		 262 aa  394  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1436  enoyl-CoA hydratase  73.05 
 
 		 269 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.518043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1221  enoyl-CoA hydratase/isomerase  67.45 
 
 		 273 aa  348  6e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212556  normal  0.0915283 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0757  enoyl-CoA hydratase  69.53 
 
 		 269 aa  347  8e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.86 
 
 		 269 aa  346  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.71 
 
 		 269 aa  343  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2554  enoyl-CoA hydratase  70.47 
 
 		 267 aa  342  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.32 
 
 		 269 aa  337  8e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0993  enoyl-CoA hydratase  69.67 
 
 		 269 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  68.03 
 
 		 269 aa  333  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  61 
 
 		 262 aa  329  3e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2388  enoyl-CoA hydratase/isomerase  67.72 
 
 		 269 aa  328  7e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  63.89 
 
 		 269 aa  327  8e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  64.96 
 
 		 280 aa  325  6e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  65.87 
 
 		 272 aa  322  5e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  65.48 
 
 		 272 aa  321  9.000000000000001e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  62.89 
 
 		 278 aa  315  4e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  62.5 
 
 		 264 aa  314  9e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  62.11 
 
 		 264 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  62.11 
 
 		 290 aa  310  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  62.11 
 
 		 290 aa  310  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  62.99 
 
 		 264 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  60.31 
 
 		 264 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  61.33 
 
 		 264 aa  305  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  61.81 
 
 		 261 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  61.42 
 
 		 261 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.26 
 
 		 274 aa  301  6.000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  61.02 
 
 		 261 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  59.22 
 
 		 266 aa  295  5e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2717  enoyl-CoA hydratase  58.8 
 
 		 265 aa  291  7e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  60.47 
 
 		 272 aa  291  9e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  60.47 
 
 		 272 aa  291  9e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.2 
 
 		 261 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  61.26 
 
 		 257 aa  279  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  59.45 
 
 		 270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  55.81 
 
 		 261 aa  270  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.85 
 
 		 273 aa  270  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  53.46 
 
 		 264 aa  269  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.73 
 
 		 263 aa  268  5.9999999999999995e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  55.43 
 
 		 261 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  54.26 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  52.76 
 
 		 261 aa  258  6e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  50 
 
 		 262 aa  256  4e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.02 
 
 		 265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.77 
 
 		 266 aa  243  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  51.72 
 
 		 273 aa  242  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  51.23 
 
 		 264 aa  242  5e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.87 
 
 		 275 aa  241  7.999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  52.9 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  50.77 
 
 		 266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  49.81 
 
 		 275 aa  234  8e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  48.67 
 
 		 275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  49.42 
 
 		 275 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4341  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.9 
 
 		 276 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.538809  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.48 
 
 		 270 aa  233  3e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.37 
 
 		 260 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  48.66 
 
 		 274 aa  225  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4900  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.75 
 
 		 266 aa  223  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2559  enoyl-CoA hydratase  52.53 
 
 		 261 aa  221  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.36 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.403885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.17 
 
 		 260 aa  216  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1325  enoyl-CoA hydratase  47.29 
 
 		 277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1947  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  41.98 
 
 		 270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4950  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.39 
 
 		 265 aa  209  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.08 
 
 		 269 aa  199  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0864  enoyl-CoA hydratase  48.25 
 
 		 273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281406  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.68 
 
 		 263 aa  192  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29450  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  44.66 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 		 258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6127  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.27 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4125  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.31 
 
 		 257 aa  175  7e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.04 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  40.24 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.61 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6471  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.8 
 
 		 264 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.01 
 
 		 258 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  40.48 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3291  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.04 
 
 		 263 aa  145  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  39.02 
 
 		 264 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6359  enoyl-CoA hydratase  36.9 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0245012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1889  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.8 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  38.62 
 
 		 264 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.18 
 
 		 262 aa  140  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.346332 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.13 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  30.35 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 		 259 aa  139  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.18 
 
 		 262 aa  138  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.80898  normal  0.0526792 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2927  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 		 273 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 		 254 aa  138  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4127  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128801  normal  0.190874 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  35.37 
 
 		 268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  34.48 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3642  enoyl-CoA hydratase  36.95 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.48 
 
 		 260 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  35.34 
 
 		 266 aa  135  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1173  enoyl-CoA hydratase  35.86 
 
 		 262 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>