More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_29450 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_29450  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  100 
 
 
257 aa  515  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6127  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  77.08 
 
 
255 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4125  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  77.51 
 
 
257 aa  385  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.68 
 
 
263 aa  316  2e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  50.59 
 
 
264 aa  248  8e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.89 
 
 
265 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46 
 
 
270 aa  205  5e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.23 
 
 
269 aa  203  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0993  enoyl-CoA hydratase  48.35 
 
 
269 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  47.93 
 
 
269 aa  203  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.56 
 
 
273 aa  201  8e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0757  enoyl-CoA hydratase  47.11 
 
 
269 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457291  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  46.56 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  46.83 
 
 
266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.74 
 
 
269 aa  199  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.53 
 
 
269 aa  198  7e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  46.94 
 
 
278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.75 
 
 
269 aa  195  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  48.97 
 
 
280 aa  194  9e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  45.93 
 
 
264 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  46.34 
 
 
264 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  46.34 
 
 
290 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  46.34 
 
 
290 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  44.05 
 
 
269 aa  192  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.7 
 
 
263 aa  192  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 
274 aa  192  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2717  enoyl-CoA hydratase  44.27 
 
 
265 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  46.8 
 
 
272 aa  192  6e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  45.45 
 
 
266 aa  191  8e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  44.13 
 
 
262 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  45.53 
 
 
264 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46 
 
 
272 aa  190  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  45.63 
 
 
272 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  45.16 
 
 
273 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  45.71 
 
 
264 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  45.63 
 
 
272 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  46.25 
 
 
261 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.85 
 
 
262 aa  188  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  44 
 
 
274 aa  188  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  45.12 
 
 
261 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  45.12 
 
 
261 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  44.76 
 
 
275 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  45.12 
 
 
261 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  47.22 
 
 
257 aa  187  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  45.97 
 
 
264 aa  186  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.66 
 
 
260 aa  186  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  43.95 
 
 
275 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2554  enoyl-CoA hydratase  48.33 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1436  enoyl-CoA hydratase  46.72 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.518043  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1947  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  38.76 
 
 
270 aa  181  7e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4341  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.64 
 
 
276 aa  181  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.538809  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2388  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.09 
 
 
269 aa  181  9.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  42.52 
 
 
275 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  41.53 
 
 
275 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1221  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.29 
 
 
273 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212556  normal  0.0915283 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.12 
 
 
261 aa  175  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  40.7 
 
 
264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  42.41 
 
 
262 aa  172  5.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.25 
 
 
275 aa  170  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.54 
 
 
260 aa  168  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2559  enoyl-CoA hydratase  43.41 
 
 
261 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0864  enoyl-CoA hydratase  42.45 
 
 
273 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281406  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4900  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.7 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1325  enoyl-CoA hydratase  39.16 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 
266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.7 
 
 
270 aa  162  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.403885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.69 
 
 
260 aa  160  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  40.86 
 
 
261 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4950  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.13 
 
 
265 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  40.47 
 
 
261 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  38.64 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.89 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.06 
 
 
261 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 
258 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 
260 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  35.45 
 
 
265 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  32.55 
 
 
257 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.88 
 
 
260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 
258 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 
261 aa  118  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.44 
 
 
258 aa  118  9e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6107  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  37.55 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 
263 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 
263 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 
263 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 
263 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 
263 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 
263 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.11 
 
 
260 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 
263 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0949  enoyl-CoA hydratase  35.45 
 
 
261 aa  115  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362092  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 
258 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1666  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
259 aa  115  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.458425  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  36.72 
 
 
260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  36.58 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0804  enoyl-CoA hydratase  35.45 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0469  enoyl-CoA hydratase  35.45 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1606  enoyl-CoA hydratase  35.45 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>