More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2559 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2559  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 261 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  61.9 
 
 		 270 aa  309  4e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.69 
 
 		 265 aa  307  9e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  62.6 
 
 		 261 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.73 
 
 		 263 aa  301  5.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.24 
 
 		 273 aa  299  4e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  61.98 
 
 		 275 aa  298  5e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  57.69 
 
 		 273 aa  294  9e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.62 
 
 		 275 aa  293  3e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  58.78 
 
 		 275 aa  291  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  60.38 
 
 		 275 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  59.32 
 
 		 275 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  55 
 
 		 262 aa  285  8e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  57.81 
 
 		 266 aa  283  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  55.6 
 
 		 269 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  59.13 
 
 		 272 aa  279  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  56.32 
 
 		 266 aa  279  3e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  59.13 
 
 		 272 aa  279  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  56.03 
 
 		 264 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  56.03 
 
 		 278 aa  276  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.34 
 
 		 274 aa  276  2e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  56.03 
 
 		 290 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  56.03 
 
 		 290 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  55.25 
 
 		 264 aa  274  9e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  54.09 
 
 		 264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.86 
 
 		 269 aa  274  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  55.94 
 
 		 261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  55.94 
 
 		 261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  55.94 
 
 		 261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4341  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.7 
 
 		 276 aa  272  5.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.538809  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  54.09 
 
 		 264 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  56.25 
 
 		 264 aa  270  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  54.86 
 
 		 264 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4900  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.86 
 
 		 266 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1436  enoyl-CoA hydratase  54.83 
 
 		 269 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.518043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  55.21 
 
 		 274 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.12 
 
 		 260 aa  265  8e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.53 
 
 		 260 aa  263  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  51.17 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.64 
 
 		 270 aa  263  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.403885 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2717  enoyl-CoA hydratase  52.94 
 
 		 265 aa  260  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.53 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.28 
 
 		 269 aa  259  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  51.74 
 
 		 261 aa  257  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1325  enoyl-CoA hydratase  54.09 
 
 		 277 aa  256  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.88 
 
 		 262 aa  256  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4950  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.33 
 
 		 265 aa  255  4e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0757  enoyl-CoA hydratase  54.8 
 
 		 269 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.53 
 
 		 260 aa  251  7e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  51.35 
 
 		 261 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  51.35 
 
 		 261 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2554  enoyl-CoA hydratase  54.26 
 
 		 267 aa  249  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0993  enoyl-CoA hydratase  54.66 
 
 		 269 aa  248  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  50.78 
 
 		 262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  53.44 
 
 		 269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.78 
 
 		 266 aa  243  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1947  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  44.11 
 
 		 270 aa  236  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0864  enoyl-CoA hydratase  55.08 
 
 		 273 aa  234  8e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281406  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.04 
 
 		 270 aa  229  3e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.05 
 
 		 269 aa  229  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.18 
 
 		 261 aa  228  6e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  48.83 
 
 		 272 aa  226  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1221  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.66 
 
 		 273 aa  226  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212556  normal  0.0915283 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  50.8 
 
 		 280 aa  225  6e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.44 
 
 		 272 aa  225  7e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  50.78 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2388  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.8 
 
 		 269 aa  221  9e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.66 
 
 		 263 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.48 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29450  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  43.41 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6127  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.9 
 
 		 255 aa  192  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4125  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.67 
 
 		 257 aa  193  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.5 
 
 		 255 aa  158  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.65 
 
 		 260 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2206  enoyl-CoA hydratase  35.47 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0233003  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2437  enoyl-CoA hydratase  36.76 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  35.63 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6471  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.44 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  37.7 
 
 		 257 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.25 
 
 		 258 aa  149  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3258  enoyl-CoA hydratase  35.97 
 
 		 259 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2177  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.73 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.59 
 
 		 260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.45 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.08 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.09 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.48 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.36 
 
 		 273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.31 
 
 		 261 aa  145  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17860  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  32.44 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213095  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.97 
 
 		 254 aa  145  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.76 
 
 		 257 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 		 255 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 		 255 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 		 255 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  35.97 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.69 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>