More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3360 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
269 aa  539  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  48.09 
 
 
264 aa  246  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  51.39 
 
 
270 aa  245  6e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  55.02 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  53.85 
 
 
266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
273 aa  241  9e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  51.37 
 
 
275 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  50.98 
 
 
275 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  51.18 
 
 
275 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.39 
 
 
263 aa  236  4e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.65 
 
 
263 aa  233  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.39 
 
 
273 aa  230  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.07 
 
 
269 aa  227  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.86 
 
 
270 aa  225  5.0000000000000005e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  48.83 
 
 
274 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.76 
 
 
265 aa  222  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  47.84 
 
 
275 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4341  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.19 
 
 
276 aa  221  8e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.538809  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1325  enoyl-CoA hydratase  49.58 
 
 
277 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.41 
 
 
275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.5 
 
 
269 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  46.37 
 
 
269 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0864  enoyl-CoA hydratase  52.11 
 
 
273 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281406  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.09 
 
 
269 aa  209  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  45.8 
 
 
269 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  46.72 
 
 
264 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  46.72 
 
 
264 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  46.72 
 
 
264 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  47.13 
 
 
264 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  46.72 
 
 
290 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  46.72 
 
 
290 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  43.6 
 
 
264 aa  204  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6127  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.75 
 
 
255 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  47.13 
 
 
278 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
274 aa  203  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29450  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  45.23 
 
 
257 aa  203  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  44.08 
 
 
262 aa  202  4e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  44.31 
 
 
262 aa  202  6e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2559  enoyl-CoA hydratase  52.05 
 
 
261 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  47.54 
 
 
280 aa  201  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  46.46 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2717  enoyl-CoA hydratase  46.28 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0993  enoyl-CoA hydratase  45.56 
 
 
269 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  46.31 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1436  enoyl-CoA hydratase  44.67 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.518043  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.06 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  43.6 
 
 
261 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.08 
 
 
260 aa  199  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2388  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.25 
 
 
269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.9 
 
 
260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  44.4 
 
 
261 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4125  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.08 
 
 
257 aa  199  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.77 
 
 
260 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  46.72 
 
 
264 aa  198  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  44.4 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  46.72 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0757  enoyl-CoA hydratase  46.72 
 
 
269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457291  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  46.72 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  46.72 
 
 
261 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.67 
 
 
262 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  44.17 
 
 
257 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1947  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  40.65 
 
 
270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2554  enoyl-CoA hydratase  46.72 
 
 
267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4950  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.75 
 
 
265 aa  189  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.43 
 
 
266 aa  188  7e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4900  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.53 
 
 
266 aa  188  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.94 
 
 
270 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.403885 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  45.49 
 
 
272 aa  185  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  45.49 
 
 
272 aa  185  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.93 
 
 
258 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1221  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.42 
 
 
273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212556  normal  0.0915283 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.64 
 
 
261 aa  171  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.14 
 
 
258 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  36.86 
 
 
258 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 
258 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.08 
 
 
258 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.48 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.2 
 
 
258 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  37.11 
 
 
257 aa  142  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2177  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 
255 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  32.3 
 
 
259 aa  135  7.000000000000001e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.54 
 
 
261 aa  135  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  33.33 
 
 
260 aa  133  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1190  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.25 
 
 
258 aa  133  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.92 
 
 
255 aa  132  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  32.13 
 
 
258 aa  132  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  35.57 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.85 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1666  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.458425  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.01 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  34.27 
 
 
257 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  35.06 
 
 
259 aa  129  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  35.18 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6471  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.89 
 
 
264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.25 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  30.98 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
263 aa  126  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
259 aa  126  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>