More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1221 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1221  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
273 aa  556  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212556  normal  0.0915283 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1436  enoyl-CoA hydratase  68.08 
 
 
269 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.518043  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  68.97 
 
 
280 aa  355  3.9999999999999996e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  68.38 
 
 
272 aa  349  4e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  68.38 
 
 
272 aa  348  6e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  67.45 
 
 
260 aa  348  6e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2388  enoyl-CoA hydratase/isomerase  70.16 
 
 
269 aa  346  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  67.45 
 
 
262 aa  345  4e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.89 
 
 
269 aa  340  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.57 
 
 
269 aa  339  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.67 
 
 
269 aa  332  5e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0993  enoyl-CoA hydratase  65.98 
 
 
269 aa  328  7e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  64.75 
 
 
269 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0757  enoyl-CoA hydratase  63.64 
 
 
269 aa  322  5e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457291  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2554  enoyl-CoA hydratase  61.96 
 
 
267 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  57.87 
 
 
262 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  58.5 
 
 
269 aa  296  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  58.2 
 
 
278 aa  293  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  56.03 
 
 
264 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  56.42 
 
 
290 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  56.42 
 
 
264 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  56.42 
 
 
290 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  56.03 
 
 
264 aa  288  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  57.25 
 
 
264 aa  288  7e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  56.13 
 
 
264 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  57.83 
 
 
261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  55.86 
 
 
266 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  57.43 
 
 
261 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  57.03 
 
 
261 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.92 
 
 
261 aa  275  7e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2717  enoyl-CoA hydratase  55.38 
 
 
265 aa  275  8e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  56.28 
 
 
272 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  56.28 
 
 
272 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.19 
 
 
274 aa  272  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  52.92 
 
 
261 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  50.19 
 
 
264 aa  261  6.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.57 
 
 
266 aa  260  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  54.33 
 
 
261 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  53.94 
 
 
261 aa  258  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  56.35 
 
 
257 aa  254  9e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.47 
 
 
275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  50.38 
 
 
275 aa  248  8e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  50.39 
 
 
261 aa  248  9e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
275 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.06 
 
 
265 aa  248  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  47.67 
 
 
262 aa  246  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  50.96 
 
 
275 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  49.23 
 
 
275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  51.19 
 
 
270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.63 
 
 
270 aa  236  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  50.61 
 
 
273 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.22 
 
 
263 aa  235  7e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.06 
 
 
273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  49.03 
 
 
266 aa  226  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4341  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.25 
 
 
276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.538809  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  46.99 
 
 
274 aa  214  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  45.06 
 
 
264 aa  214  9e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.51 
 
 
260 aa  211  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4900  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.67 
 
 
266 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1325  enoyl-CoA hydratase  45.91 
 
 
277 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.22 
 
 
260 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.27 
 
 
270 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.403885 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2559  enoyl-CoA hydratase  47.66 
 
 
261 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1947  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  39.85 
 
 
270 aa  193  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4950  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.09 
 
 
265 aa  192  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0864  enoyl-CoA hydratase  43.56 
 
 
273 aa  189  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281406  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6127  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.03 
 
 
255 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.68 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29450  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  42.29 
 
 
257 aa  176  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.06 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.42 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4125  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
257 aa  159  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  38.89 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6359  enoyl-CoA hydratase  34.52 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0245012  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6471  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.94 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  36.44 
 
 
258 aa  138  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0016  enoyl-CoA hydratase  35.34 
 
 
264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0013  enoyl-CoA hydratase  35.34 
 
 
264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.76945  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1889  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.5 
 
 
261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
260 aa  132  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1856  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128086  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05478  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.24 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3042  enoyl-CoA hydratase  36.59 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.421055  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2927  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.31 
 
 
273 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  36.59 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  34.5 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.02 
 
 
255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  34.8 
 
 
264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 
268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.02 
 
 
255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.02 
 
 
255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2144  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.39 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268897  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0041  enoyl-CoA hydratase  34.54 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568565  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2054  enoyl-CoA hydratase  36.08 
 
 
261 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577425  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0804  enoyl-CoA hydratase  36.08 
 
 
261 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0469  enoyl-CoA hydratase  36.08 
 
 
261 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1957  enoyl-CoA hydratase  36.08 
 
 
261 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>