More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2967 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 266 aa  533  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  64.2 
 
 		 261 aa  334  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  64.2 
 
 		 261 aa  332  4e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  63.42 
 
 		 261 aa  327  8e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  62.55 
 
 		 264 aa  317  9e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  58.08 
 
 		 262 aa  315  5e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  55.73 
 
 		 275 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.15 
 
 		 275 aa  285  5.999999999999999e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  55.6 
 
 		 275 aa  278  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  54.2 
 
 		 275 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  55.43 
 
 		 273 aa  276  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  54.2 
 
 		 275 aa  275  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  53.67 
 
 		 266 aa  271  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  54.14 
 
 		 264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  54.58 
 
 		 278 aa  266  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  54.83 
 
 		 264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  53.31 
 
 		 272 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  53.31 
 
 		 272 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  54.05 
 
 		 264 aa  264  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  53.58 
 
 		 261 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  54.44 
 
 		 290 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  54.44 
 
 		 290 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  54.05 
 
 		 264 aa  262  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.94 
 
 		 263 aa  263  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.92 
 
 		 273 aa  262  4.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  53.21 
 
 		 261 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  54.03 
 
 		 266 aa  261  8e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  53.21 
 
 		 261 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1221  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.57 
 
 		 273 aa  260  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212556  normal  0.0915283 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  52.33 
 
 		 269 aa  259  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  51.71 
 
 		 262 aa  259  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  53.05 
 
 		 264 aa  257  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.69 
 
 		 269 aa  256  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.92 
 
 		 269 aa  256  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.31 
 
 		 269 aa  256  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.08 
 
 		 262 aa  254  8e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.69 
 
 		 274 aa  251  1e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.59 
 
 		 265 aa  250  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  54.09 
 
 		 257 aa  249  3e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0993  enoyl-CoA hydratase  53.63 
 
 		 269 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  52.82 
 
 		 269 aa  248  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.94 
 
 		 260 aa  247  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0757  enoyl-CoA hydratase  51.98 
 
 		 269 aa  246  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  52.69 
 
 		 261 aa  246  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2717  enoyl-CoA hydratase  49.8 
 
 		 265 aa  245  6e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4341  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.09 
 
 		 276 aa  244  6.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.538809  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.77 
 
 		 260 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  51.94 
 
 		 270 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  50.78 
 
 		 272 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.87 
 
 		 270 aa  242  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.403885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4900  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.49 
 
 		 266 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  48.47 
 
 		 274 aa  240  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1436  enoyl-CoA hydratase  50.38 
 
 		 269 aa  240  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.518043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  49.03 
 
 		 264 aa  238  5.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 		 272 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.73 
 
 		 260 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  52.57 
 
 		 280 aa  236  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4950  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.69 
 
 		 265 aa  233  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2554  enoyl-CoA hydratase  50.19 
 
 		 267 aa  227  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1325  enoyl-CoA hydratase  46.3 
 
 		 277 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2388  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.03 
 
 		 269 aa  224  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0864  enoyl-CoA hydratase  50.76 
 
 		 273 aa  224  9e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281406  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.58 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2559  enoyl-CoA hydratase  50.78 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.39 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1947  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  38.85 
 
 		 270 aa  192  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.43 
 
 		 269 aa  188  7e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.15 
 
 		 258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.41 
 
 		 263 aa  182  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4125  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.23 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29450  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  40.08 
 
 		 257 aa  162  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6127  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.8 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.59 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.22 
 
 		 258 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  37.59 
 
 		 258 aa  148  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  40.86 
 
 		 263 aa  145  9e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.52 
 
 		 257 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6471  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.75 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0804  enoyl-CoA hydratase  40.46 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1606  enoyl-CoA hydratase  40.46 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2054  enoyl-CoA hydratase  40.46 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577425  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0469  enoyl-CoA hydratase  40.46 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0540  enoyl-CoA hydratase  40.46 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0652  enoyl-CoA hydratase  40.46 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.572722  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1957  enoyl-CoA hydratase  40.46 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 		 268 aa  142  4e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 		 254 aa  143  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1228  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.98 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115754  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3413  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.76 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0949  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362092  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.17 
 
 		 261 aa  139  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6359  enoyl-CoA hydratase  34.36 
 
 		 267 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0245012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.49 
 
 		 258 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.6 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.6 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2144  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.6 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2177  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.14 
 
 		 255 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>