More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2094 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
257 aa  517  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  65.18 
 
 
261 aa  321  8e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  65.18 
 
 
261 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  62.99 
 
 
264 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  64.78 
 
 
261 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  63.39 
 
 
290 aa  318  6e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  63.39 
 
 
290 aa  318  6e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  65.35 
 
 
272 aa  317  9e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  65.35 
 
 
272 aa  317  9e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  62.99 
 
 
264 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  62.99 
 
 
264 aa  316  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  64.03 
 
 
264 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  62.85 
 
 
278 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  61.42 
 
 
264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3470  enoyl-CoA hydratase  60.63 
 
 
266 aa  305  6e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2075  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.26 
 
 
260 aa  296  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165609 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2717  enoyl-CoA hydratase  60.08 
 
 
265 aa  297  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.52 
 
 
269 aa  295  5e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.55 
 
 
262 aa  294  8e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.52 
 
 
269 aa  286  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.92 
 
 
269 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  59.45 
 
 
280 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  58.23 
 
 
272 aa  278  4e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  55.34 
 
 
262 aa  277  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0757  enoyl-CoA hydratase  58.37 
 
 
269 aa  277  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457291  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1436  enoyl-CoA hydratase  57.31 
 
 
269 aa  276  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.518043  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.83 
 
 
272 aa  275  4e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.83 
 
 
273 aa  270  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1221  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.35 
 
 
273 aa  271  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212556  normal  0.0915283 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2990  enoyl-CoA hydratase  56.73 
 
 
269 aa  269  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241873 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  56.52 
 
 
269 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0993  enoyl-CoA hydratase  57.55 
 
 
269 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.78 
 
 
274 aa  264  1e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.9 
 
 
263 aa  261  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  53.06 
 
 
262 aa  260  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.09 
 
 
266 aa  260  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  54.2 
 
 
261 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  54.2 
 
 
261 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2554  enoyl-CoA hydratase  58.66 
 
 
267 aa  258  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2388  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.82 
 
 
269 aa  257  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  53.05 
 
 
261 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  50.19 
 
 
264 aa  249  4e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.84 
 
 
265 aa  244  8e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  49.03 
 
 
266 aa  241  6e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  49.03 
 
 
275 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.16 
 
 
275 aa  238  5e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  54.15 
 
 
270 aa  238  5e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  52.23 
 
 
273 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  49.42 
 
 
275 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  51.04 
 
 
264 aa  231  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
261 aa  230  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.45 
 
 
261 aa  228  9e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.63 
 
 
270 aa  223  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  47.1 
 
 
275 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  47.1 
 
 
275 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.17 
 
 
260 aa  218  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.61 
 
 
270 aa  210  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.403885 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1325  enoyl-CoA hydratase  46.4 
 
 
277 aa  209  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  44.79 
 
 
274 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4900  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.61 
 
 
266 aa  209  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4341  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.61 
 
 
276 aa  209  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.538809  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2559  enoyl-CoA hydratase  50.78 
 
 
261 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.31 
 
 
263 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.39 
 
 
260 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3360  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.17 
 
 
269 aa  199  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.439812  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4950  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.59 
 
 
265 aa  199  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29450  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  47.22 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6127  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.35 
 
 
255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0864  enoyl-CoA hydratase  47.97 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281406  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1947  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  39.27 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4125  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44 
 
 
257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.623043  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.82 
 
 
258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  38.76 
 
 
258 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.37 
 
 
258 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.76 
 
 
258 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  34.9 
 
 
259 aa  148  7e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2177  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 
255 aa  142  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0109  enoyl-CoA hydratase  38.28 
 
 
259 aa  141  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0102  enoyl-CoA hydratase  38.84 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1196  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.72 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6471  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.02 
 
 
264 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 
254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  34.16 
 
 
257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 
264 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  36.69 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  37.1 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.25 
 
 
262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.346332 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1228  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.99 
 
 
255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115754  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  34.84 
 
 
263 aa  132  6e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  32.8 
 
 
265 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2144  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.55 
 
 
253 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268897  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.68 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.75 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  34.48 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3291  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.12 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
260 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2090  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.82 
 
 
253 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0323462  normal  0.4563 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.98 
 
 
257 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>